More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2103 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  100 
 
 		 384 aa  768    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  51.47 
 
 		 360 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  45.03 
 
 		 387 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  48.61 
 
 		 385 aa  292  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  41.11 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  41.75 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  37.34 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  40.05 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  39.14 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  39.12 
 
 		 390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  38.82 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  38.66 
 
 		 394 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  40.52 
 
 		 385 aa  229  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  40.26 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.69 
 
 		 388 aa  226  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.37 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  35.98 
 
 		 389 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  38.13 
 
 		 391 aa  222  9e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  38.99 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  38.99 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  38.99 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  38.82 
 
 		 390 aa  218  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  38.12 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  37.14 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  38.28 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  34.29 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  34.96 
 
 		 396 aa  202  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  36.36 
 
 		 389 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  35.55 
 
 		 385 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  35.01 
 
 		 395 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  35.18 
 
 		 397 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.18 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.18 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.18 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.18 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.18 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  38.11 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  37.56 
 
 		 383 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  33.16 
 
 		 405 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.49 
 
 		 397 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.9 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.9 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  38.67 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.63 
 
 		 388 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  36.94 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  34.11 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  35.73 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  37.6 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  35.71 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  37.94 
 
 		 381 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  35.71 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  36.29 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.9 
 
 		 388 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  32.92 
 
 		 394 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  36.46 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  34.5 
 
 		 453 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  36.01 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  35.7 
 
 		 385 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  36.06 
 
 		 389 aa  176  9e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.9 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.13 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  33.43 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  31.79 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  32.12 
 
 		 396 aa  173  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  35.86 
 
 		 388 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  38.1 
 
 		 403 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  32.33 
 
 		 379 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  30.87 
 
 		 383 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  36.91 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  37.43 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  35.29 
 
 		 383 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  37.5 
 
 		 402 aa  167  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  37.5 
 
 		 402 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  34.64 
 
 		 381 aa  166  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  31.68 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  34.01 
 
 		 548 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  30.94 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  32.23 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  34.08 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  33.68 
 
 		 389 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  36.81 
 
 		 381 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  32.16 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  34.15 
 
 		 550 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  32.16 
 
 		 548 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  31.58 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  33.91 
 
 		 550 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  33.91 
 
 		 550 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3874  hypothetical protein  33.95 
 
 		 393 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  34.2 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  31.98 
 
 		 386 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  35.85 
 
 		 389 aa  155  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  32.32 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  32.9 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  31.52 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  37.24 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  37.22 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  32.1 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  31.69 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  32.05 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>