125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2090 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  785    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 405 aa  170  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 410 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  32 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  29.31 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  26.6 
 
 		 423 aa  106  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  26.6 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  26.74 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 381 aa  96.7  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  28.02 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 403 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 402 aa  93.2  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  26.27 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  22.67 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  20.24 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  31.02 
 
 		 476 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  21.41 
 
 		 401 aa  53.1  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  21.76 
 
 		 405 aa  53.1  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  29.71 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.98 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.98 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 480 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 439 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.05 
 
 		 578 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.86 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.32 
 
 		 485 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  25.08 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  27.49 
 
 		 481 aa  47.8  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3218  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2302  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.85 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 418 aa  47  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.67 
 
 		 472 aa  46.6  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  29.86 
 
 		 416 aa  46.6  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  28.68 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  25.2 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.45 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.226188 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2744  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.67 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000519122 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  28.68 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.84 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.17 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  28.06 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  28.68 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.93 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.32 
 
 		 509 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1452  hypothetical protein  32.58 
 
 		 604 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.39 
 
 		 505 aa  44.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.66 
 
 		 561 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.58 
 
 		 493 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04730  arabinose efflux permease family protein  27.52 
 
 		 529 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4881  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 850 aa  44.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 471 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.17 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.88 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 437 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.4 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.31 
 
 		 485 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4653  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  22.49 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>