More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2059 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  100 
 
 		 569 aa  1150    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  50.36 
 
 		 564 aa  518  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  47.57 
 
 		 569 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  47.51 
 
 		 573 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  45.57 
 
 		 576 aa  461  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  45.88 
 
 		 564 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  44.69 
 
 		 573 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  34.03 
 
 		 613 aa  316  7e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  34.3 
 
 		 608 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  36.91 
 
 		 560 aa  306  8.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  34.77 
 
 		 596 aa  294  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  36.76 
 
 		 542 aa  290  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  34.91 
 
 		 543 aa  284  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  38.24 
 
 		 574 aa  273  8.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  33.97 
 
 		 569 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  35.04 
 
 		 542 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  35.11 
 
 		 537 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  32.67 
 
 		 575 aa  250  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  32.43 
 
 		 544 aa  246  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  33.57 
 
 		 535 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28.24 
 
 		 574 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  31.99 
 
 		 556 aa  239  9e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  32.91 
 
 		 565 aa  236  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  33.46 
 
 		 545 aa  230  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  31.81 
 
 		 529 aa  229  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  30 
 
 		 541 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  33.63 
 
 		 601 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  31.17 
 
 		 580 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  31.72 
 
 		 584 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  33.04 
 
 		 589 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  32.06 
 
 		 564 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  30.48 
 
 		 582 aa  211  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  31.02 
 
 		 580 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  31.82 
 
 		 532 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  32.39 
 
 		 538 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  33.09 
 
 		 583 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  30.11 
 
 		 553 aa  205  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  33.09 
 
 		 583 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  32.65 
 
 		 603 aa  204  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  32.44 
 
 		 583 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  33.09 
 
 		 543 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  31.46 
 
 		 545 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  28.62 
 
 		 585 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  31.26 
 
 		 606 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  30.63 
 
 		 560 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.91 
 
 		 546 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.06 
 
 		 549 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.13 
 
 		 544 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  31.13 
 
 		 560 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  28.44 
 
 		 556 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  29.09 
 
 		 583 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  30.09 
 
 		 565 aa  198  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  32.27 
 
 		 620 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  32.53 
 
 		 522 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  30.8 
 
 		 616 aa  197  6e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  29.73 
 
 		 546 aa  196  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  31.21 
 
 		 547 aa  196  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.85 
 
 		 565 aa  194  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  32.22 
 
 		 553 aa  194  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  28.1 
 
 		 583 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  27.98 
 
 		 520 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  27.72 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  27.69 
 
 		 522 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  27.53 
 
 		 522 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  27.92 
 
 		 583 aa  191  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  28.48 
 
 		 548 aa  190  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  27.29 
 
 		 522 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  27.97 
 
 		 522 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  27.53 
 
 		 522 aa  189  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.06 
 
 		 557 aa  189  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.46 
 
 		 560 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  27.48 
 
 		 522 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  27.48 
 
 		 522 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  27.48 
 
 		 522 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  27.1 
 
 		 522 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  28.78 
 
 		 558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  30.3 
 
 		 544 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  26.93 
 
 		 550 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  30.68 
 
 		 548 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  30.68 
 
 		 548 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  30.68 
 
 		 548 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  28.4 
 
 		 553 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  29.66 
 
 		 634 aa  180  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  29.54 
 
 		 530 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.88 
 
 		 539 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  27.92 
 
 		 556 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  30.54 
 
 		 576 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  28.88 
 
 		 619 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  28.41 
 
 		 552 aa  176  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  29.98 
 
 		 568 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  30.39 
 
 		 530 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  32.37 
 
 		 548 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  32.79 
 
 		 535 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.33 
 
 		 538 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.2 
 
 		 575 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.2 
 
 		 575 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.17 
 
 		 520 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  29.38 
 
 		 557 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  33.13 
 
 		 536 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  28.96 
 
 		 626 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>