222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2036 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2036  hydantoinase B/oxoprolinase  100 
 
 
600 aa  1222    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.524189  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5621  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.05 
 
 
708 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.99583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5330  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.8 
 
 
708 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3096  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.17 
 
 
775 aa  350  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16642  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5242  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.02 
 
 
646 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.860523  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.52 
 
 
564 aa  243  7e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.05 
 
 
582 aa  237  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.88 
 
 
577 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.18 
 
 
681 aa  233  9e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  29.53 
 
 
640 aa  231  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  28.81 
 
 
578 aa  231  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.45 
 
 
657 aa  226  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.83 
 
 
580 aa  220  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.57 
 
 
577 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.72 
 
 
548 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2261  hydantoinase B/oxoprolinase  30.1 
 
 
581 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.06 
 
 
562 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1152  hydantoinase B/oxoprolinase  27.56 
 
 
747 aa  215  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3514  hydantoinase B/oxoprolinase  29.77 
 
 
581 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2414  hydantoinase B/oxoprolinase  29.45 
 
 
581 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.49373  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3090  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.39 
 
 
645 aa  210  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0547803  hitchhiker  0.000201646 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.2 
 
 
586 aa  209  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.82 
 
 
548 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.95 
 
 
515 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4926  Hydantoin utilization protein B  29.72 
 
 
551 aa  207  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253759  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4409  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.64 
 
 
582 aa  206  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.71 
 
 
556 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6273  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.81 
 
 
634 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0677788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3492  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.06 
 
 
645 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  29.68 
 
 
565 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2084  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.36 
 
 
587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81629  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.68 
 
 
519 aa  201  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.13 
 
 
577 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4352  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.23 
 
 
594 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  29.58 
 
 
674 aa  200  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.24 
 
 
660 aa  199  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.91 
 
 
564 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4429  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.26 
 
 
581 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  30.45 
 
 
563 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.14 
 
 
597 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2859  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.57 
 
 
629 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832595  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  27.51 
 
 
566 aa  190  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.4 
 
 
589 aa  190  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2646  hydantoinase B/oxoprolinase  26.95 
 
 
647 aa  189  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1520  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.21 
 
 
588 aa  189  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.2 
 
 
845 aa  189  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8174  hydantoin utilization protein  26.95 
 
 
585 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4084  Hydantoinase B/oxoprolinase  29.08 
 
 
589 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1448  acetone carboxylase alpha subunit  25.56 
 
 
768 aa  186  8e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.674033 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8487  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.3 
 
 
671 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2132  Hydantoinase B/oxoprolinase  28.03 
 
 
626 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5965  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.23 
 
 
597 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2242  hydantoinase B/oxoprolinase  26.15 
 
 
743 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1847  hydantoinase B/oxoprolinase  26.43 
 
 
686 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11380  acetophenone carboxylase  26.02 
 
 
758 aa  183  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.27 
 
 
616 aa  183  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5631  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.02 
 
 
598 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0497  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.3 
 
 
651 aa  182  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13495  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2225  5-oxoprolinase  28.16 
 
 
611 aa  182  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113832  normal  0.624978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.14 
 
 
561 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1342  hydantoinase B/oxoprolinase  25.36 
 
 
772 aa  181  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.08 
 
 
601 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.57 
 
 
575 aa  181  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0080  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.03 
 
 
572 aa  181  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.740516  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1834  hydantoinase B/oxoprolinase  26.28 
 
 
752 aa  179  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.14 
 
 
585 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5219  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.08 
 
 
568 aa  178  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.667486  normal  0.287509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2506  hydantoinase B/oxoprolinase  25.75 
 
 
774 aa  178  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.615482  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4359  hydantoinase B/oxoprolinase  26.17 
 
 
758 aa  177  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.33 
 
 
529 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  27.46 
 
 
1362 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.51 
 
 
524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0175  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.6 
 
 
628 aa  175  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1124  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.17 
 
 
568 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0518569  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0123  Hydantoinase B/oxoprolinase  29 
 
 
623 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242495  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1162  hydantoinase B/oxoprolinase  24.76 
 
 
758 aa  174  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.58 
 
 
584 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126981  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.18 
 
 
583 aa  173  9e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6535  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.26 
 
 
582 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.479598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2907  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.47 
 
 
1242 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0182829 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1105  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.99 
 
 
568 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304124 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.1 
 
 
541 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  27.62 
 
 
574 aa  170  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5989  N-methylhydantoinase B (Hydantoin utilization protein B)  30.1 
 
 
577 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5341  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.21 
 
 
633 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1781  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.65 
 
 
1213 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0522024  normal  0.0235598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2367  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.44 
 
 
530 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6594  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.32 
 
 
624 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2177  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.13 
 
 
1206 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0802  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.06 
 
 
561 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36294  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2941  5-oxoprolinase  27.5 
 
 
579 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1695  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.6 
 
 
632 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4973  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.7 
 
 
652 aa  167  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.75 
 
 
1258 aa  167  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3642  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.63 
 
 
557 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4027  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.72 
 
 
558 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0791  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.55 
 
 
670 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.549712 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  26.54 
 
 
1355 aa  164  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20950  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  27.26 
 
 
647 aa  163  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0800854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.92 
 
 
521 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>