More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2012 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2012  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
651 aa  1332    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 
642 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 
642 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2770  hypothetical protein  39.92 
 
 
641 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.911109  normal  0.95794 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4506  cyclohexanone monooxygenase  36.34 
 
 
661 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569378  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2740  hypothetical protein  39.92 
 
 
641 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2784  hypothetical protein  39.92 
 
 
641 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1842  hypothetical protein  37.28 
 
 
645 aa  355  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0316  cyclohexanone monooxygenase  31.91 
 
 
656 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140448  normal  0.328483 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3703  FAD dependent oxidoreductase  33.45 
 
 
662 aa  326  7e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  31.78 
 
 
650 aa  317  6e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.95 
 
 
816 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.2 
 
 
818 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1834  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.54 
 
 
484 aa  295  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112506  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.24 
 
 
816 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6818  putative flavin-binding monooxygenase  36.88 
 
 
479 aa  292  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.85 
 
 
816 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  33.94 
 
 
816 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0310  hypothetical protein  32.27 
 
 
627 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0320  hypothetical protein  32.27 
 
 
627 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0301  cyclohexanone monooxygenase  32.11 
 
 
627 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  34.82 
 
 
491 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01877  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  33.14 
 
 
570 aa  277  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326089  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1088  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  33.66 
 
 
499 aa  272  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437859  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  32.81 
 
 
524 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1890  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  33 
 
 
491 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239259  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  31.35 
 
 
514 aa  271  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16420  predicted flavoprotein involved in K+ transport  33.53 
 
 
525 aa  269  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  33.13 
 
 
505 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3012  Cyclohexanone monooxygenase  31.99 
 
 
540 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.96 
 
 
506 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.685298  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3698  putative monooxygenase  35.52 
 
 
529 aa  265  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.291141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2883  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 
640 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3359  Cyclohexanone monooxygenase  31.99 
 
 
548 aa  263  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562542  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2301  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  30.68 
 
 
496 aa  262  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3819  cyclohexanone monooxygenase  32.54 
 
 
527 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7122  flavin-containing monooxygenase FMO  32.93 
 
 
490 aa  262  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1881  cyclohexanone monooxygenase  31.66 
 
 
513 aa  262  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296412  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4269  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 
512 aa  262  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0844717  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1789  flavin-binding monooxygenase  32.78 
 
 
531 aa  261  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000161654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 
484 aa  261  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0977  putative flavin-binding monooxygenase  31.84 
 
 
499 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.321633 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07228  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  31.82 
 
 
565 aa  256  8e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.25292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1366  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.83 
 
 
493 aa  256  9e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4019  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 
525 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.797146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4557  hypothetical protein  32.44 
 
 
639 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0785638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1528  FAD-binding monooxygenase, putative  31.33 
 
 
496 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149589  normal  0.0289416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0895  cyclohexanone monooxygenase  33.89 
 
 
491 aa  254  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5449  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.74 
 
 
488 aa  253  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2526  flavin-binding monooxygenase-like protein  31.58 
 
 
524 aa  251  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1270  putative monooxygenase  31.79 
 
 
529 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1009  flavin-containing monooxygenase FMO  31.58 
 
 
529 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449884  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0558  4-hydroxyacetophenone monooxygenase  31.58 
 
 
529 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0347496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1145  flavin-containing monooxygenase FMO  31.67 
 
 
529 aa  250  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854282  normal  0.14107 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1471  flavin-binding monooxygenase-like protein  32 
 
 
524 aa  250  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1498  flavin-binding monooxygenase-like protein  31.3 
 
 
524 aa  249  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967842  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2987  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
493 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3031  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
493 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3747  FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 
484 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0826  flavin-containing monooxygenase FMO  31.25 
 
 
487 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4879  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 
533 aa  248  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491968  normal  0.91768 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1347  putative monooxygenase  31.79 
 
 
529 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3694  flavin-containing monooxygenase FMO  31.67 
 
 
526 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920418  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4674  flavin-containing monooxygenase FMO  31.67 
 
 
526 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727347  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5626  flavin-containing monooxygenase FMO  31.67 
 
 
526 aa  248  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0554215  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4526  flavin-containing monooxygenase FMO  31.39 
 
 
526 aa  248  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0043  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.84 
 
 
487 aa  247  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0459  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 
520 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0671859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  34.1 
 
 
489 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2620  cyclohexanone monooxygenase  30.94 
 
 
517 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581774  normal  0.881203 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13065  monooxygenase  31.65 
 
 
524 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.118559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1882  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 
487 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.57 
 
 
485 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4068  flavin-containing monooxygenase FMO  31.39 
 
 
529 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4605  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
529 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4287  putative monooxygenase  31.69 
 
 
506 aa  244  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691811  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3824  putative flavin-binding monooxygenase  27.5 
 
 
493 aa  242  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.278459  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3002  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.89 
 
 
493 aa  242  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558495  normal  0.0447488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4177  cyclohexanone monooxygenase  29.94 
 
 
503 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4546  Cyclohexanone monooxygenase  29.98 
 
 
503 aa  238  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1956  putative flavin-binding monooxygenase-like  29.36 
 
 
496 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340923  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3708  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 
494 aa  237  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0275457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1699  putative flavin-binding monooxygenase  31.68 
 
 
492 aa  236  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1698  putative monooxygenase  31.63 
 
 
508 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.647654  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4690  Cyclohexanone monooxygenase  31.29 
 
 
490 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.557659  normal  0.132484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3372  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.85 
 
 
493 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.057786  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44560  putative flavin-containing monooxygenase  29.32 
 
 
527 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.62 
 
 
504 aa  233  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623525  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10911  monooxygenase  31.47 
 
 
509 aa  233  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3104  cyclohexanone monooxygenase  32.07 
 
 
494 aa  233  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452732  normal  0.352064 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3649  flavin-containing monooxygenase FMO  27.82 
 
 
488 aa  230  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3427  putative monooxygenase  30.88 
 
 
483 aa  230  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.16956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3815  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.08 
 
 
505 aa  230  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4608  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
556 aa  229  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3201  flavoprotein involved in K+ transport-like  29.68 
 
 
509 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477657  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2059  putative monooxygenase  28.88 
 
 
506 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.587027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2243  cyclohexanone monooxygenase  31.09 
 
 
507 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4103  cyclohexanone monooxygenase  30.95 
 
 
502 aa  228  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.160816  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1273  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  29.9 
 
 
493 aa  228  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0184  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.73 
 
 
495 aa  228  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>