More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1940 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 		 422 aa  803    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  59.86 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  56.94 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.12 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  45.39 
 
 		 471 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  40.94 
 
 		 450 aa  259  9e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  41.12 
 
 		 450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  41.2 
 
 		 450 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  41.91 
 
 		 450 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.5 
 
 		 470 aa  252  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.96 
 
 		 453 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  39 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  41.46 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  40.86 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  39 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  40.67 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  40.81 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  39.55 
 
 		 460 aa  246  8e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  41.94 
 
 		 460 aa  246  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  40.71 
 
 		 493 aa  243  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.8 
 
 		 459 aa  243  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  42.67 
 
 		 443 aa  242  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.42 
 
 		 535 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  42.23 
 
 		 424 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  42.2 
 
 		 440 aa  230  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.13 
 
 		 410 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.04 
 
 		 456 aa  226  4e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.71 
 
 		 425 aa  226  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  39.29 
 
 		 410 aa  226  9e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  45.48 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.77 
 
 		 433 aa  224  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  42.06 
 
 		 438 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  46.76 
 
 		 438 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  38.79 
 
 		 463 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  45.19 
 
 		 448 aa  212  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.41 
 
 		 447 aa  210  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  46.31 
 
 		 438 aa  209  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.34 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.64 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  38.69 
 
 		 448 aa  201  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  34.62 
 
 		 452 aa  192  7e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6147  rRNA methyltransferase RsmB-like  36.19 
 
 		 421 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  29.98 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  29.98 
 
 		 451 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  33.41 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  30.66 
 
 		 426 aa  169  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  32.78 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  34.16 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3583  sun protein  33.03 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  30.39 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  30.14 
 
 		 436 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  36.11 
 
 		 451 aa  162  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  31.52 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2845  sun protein  34.72 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.677129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  28.35 
 
 		 443 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  33.09 
 
 		 448 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  29.52 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  26.77 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1863  sun protein  34.71 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  30.25 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  28.86 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04057  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.55 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  29.63 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  30.3 
 
 		 446 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.59 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.398476  normal  0.248834 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1927  Sun protein  34.25 
 
 		 429 aa  154  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  29.52 
 
 		 437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  33.65 
 
 		 449 aa  153  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  30.9 
 
 		 427 aa  152  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  28.77 
 
 		 428 aa  152  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  31.05 
 
 		 439 aa  152  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  35.42 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1498  NusB/RsmB/TIM44  35.14 
 
 		 427 aa  149  7e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.791703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.56 
 
 		 449 aa  149  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  30.37 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  30.62 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  30.62 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2083  sun protein  31.96 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.69 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  30.47 
 
 		 429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  28.35 
 
 		 462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  30.32 
 
 		 429 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  32.93 
 
 		 448 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3632  sun protein  42.45 
 
 		 450 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.10429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  28.61 
 
 		 429 aa  146  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  28.84 
 
 		 428 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  27.34 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  28.61 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  28.68 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3351  sun protein  33.8 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2626  sun protein  41.53 
 
 		 437 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  28.67 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  28.63 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  29.71 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2646  hypothetical protein  30 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  29.1 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0146  sun protein  36.73 
 
 		 469 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0350  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.73 
 
 		 519 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0165  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.73 
 
 		 469 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2801  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.73 
 
 		 469 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>