More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1939 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 316 aa  628  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  62.85 
 
 		 313 aa  349  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  63.48 
 
 		 317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  58.39 
 
 		 343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  58.63 
 
 		 320 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  58.77 
 
 		 320 aa  334  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  62.32 
 
 		 342 aa  332  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  54.32 
 
 		 316 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  60.84 
 
 		 325 aa  329  4e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  60.84 
 
 		 325 aa  329  4e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  59.47 
 
 		 321 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  58.78 
 
 		 307 aa  320  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  57.84 
 
 		 319 aa  320  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  60.42 
 
 		 287 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  57.1 
 
 		 300 aa  315  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  57.33 
 
 		 300 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  56.94 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  58.33 
 
 		 283 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  55.24 
 
 		 315 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  55.63 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  59.57 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  57.09 
 
 		 298 aa  308  9e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  57.55 
 
 		 285 aa  301  9e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  58.03 
 
 		 285 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  58.03 
 
 		 285 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  58.03 
 
 		 285 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  56.83 
 
 		 285 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  58.03 
 
 		 285 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  58.03 
 
 		 285 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  58.03 
 
 		 285 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  58.03 
 
 		 285 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  57.19 
 
 		 306 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  57.19 
 
 		 296 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  56.32 
 
 		 285 aa  298  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  58.45 
 
 		 292 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  54.66 
 
 		 324 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  57.4 
 
 		 285 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  56.83 
 
 		 285 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  57.19 
 
 		 285 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  57.19 
 
 		 285 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  57.19 
 
 		 285 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3512  heat shock protein HtpX  61.13 
 
 		 309 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  56.55 
 
 		 293 aa  295  6e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  53.09 
 
 		 279 aa  293  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  56.83 
 
 		 285 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  56.83 
 
 		 285 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  56.32 
 
 		 279 aa  288  8e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  56.27 
 
 		 286 aa  285  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  57.19 
 
 		 286 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  56.83 
 
 		 286 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  51.8 
 
 		 288 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  56.83 
 
 		 286 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  53.96 
 
 		 280 aa  278  7e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  55.43 
 
 		 281 aa  276  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  56.23 
 
 		 280 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  53.41 
 
 		 283 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  53.57 
 
 		 282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  53.58 
 
 		 286 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  50.88 
 
 		 294 aa  260  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  50.18 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  53.23 
 
 		 285 aa  256  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  50 
 
 		 296 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  51.46 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  51.93 
 
 		 284 aa  249  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  51.93 
 
 		 284 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  52.5 
 
 		 280 aa  245  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  53.33 
 
 		 285 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  52.14 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  51.58 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  45.58 
 
 		 279 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  47.86 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  46.43 
 
 		 282 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  48.79 
 
 		 297 aa  242  7e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  46.71 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  47.12 
 
 		 279 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  52.26 
 
 		 287 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  49.81 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  47.29 
 
 		 285 aa  235  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  47.35 
 
 		 280 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  47.5 
 
 		 280 aa  232  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  50.75 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  53.58 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  47.14 
 
 		 280 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0199  peptidase M48, Ste24p  49.46 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1529  peptidase M48 Ste24p  49.12 
 
 		 281 aa  229  6e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  46.07 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  46.39 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  49.06 
 
 		 285 aa  227  3e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  44.8 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  44.33 
 
 		 285 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  45.14 
 
 		 286 aa  219  3e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  44.17 
 
 		 283 aa  218  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  45.02 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  42.05 
 
 		 285 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  44.33 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  42.4 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  43.62 
 
 		 285 aa  215  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  44.8 
 
 		 286 aa  215  8e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  42.05 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  46.3 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>