67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1905 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1905  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  204  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682108  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2905  hypothetical protein  37 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  43.62 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  43.62 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  41.49 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  36.08 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  38.54 
 
 
100 aa  60.5  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  36.46 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  39.36 
 
 
96 aa  58.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  39.13 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  36.46 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  39.13 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  37.23 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  35.79 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  37.23 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  34.07 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  38.04 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  33.7 
 
 
112 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  37.76 
 
 
98 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3241  protein of unknown function DUF1330  35.71 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386279  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  37.37 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  36.14 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  31.58 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  36.46 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  33.68 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  35.42 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  32.29 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  35.79 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  34.74 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  35.35 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  30.53 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11761  hypothetical protein  30.21 
 
 
113 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0410436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  37.89 
 
 
96 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  37.89 
 
 
96 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0727  hypothetical protein  34.38 
 
 
98 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  34.74 
 
 
97 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  35.79 
 
 
110 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  36.73 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0461  hypothetical protein  29.47 
 
 
113 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1498  hypothetical protein  27.08 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  34.02 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03931  hypothetical protein  28.12 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.719494  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  31.52 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1452  hypothetical protein  27.08 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  31.91 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  32.65 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  32.65 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  32.99 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  32.65 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  35.11 
 
 
114 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0958  hypothetical protein  32.65 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  36.17 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0223  hypothetical protein  32.65 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0195535  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  30.93 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1378  hypothetical protein  32.65 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0421  hypothetical protein  32.65 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  30 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  28.42 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  27.17 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  27.17 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  27.17 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11881  hypothetical protein  27.66 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  30.85 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  35.64 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  29.03 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>