More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1901 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 744 aa  1528    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  45.61 
 
 		 766 aa  598  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 738 aa  435  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 757 aa  343  7e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 789 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  31.49 
 
 		 747 aa  305  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 807 aa  299  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 733 aa  298  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 735 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 796 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 808 aa  281  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 794 aa  278  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 759 aa  274  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 730 aa  271  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 783 aa  269  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 710 aa  269  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 723 aa  269  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 758 aa  262  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 704 aa  258  4e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 755 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 767 aa  244  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 734 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 749 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.53 
 
 		 739 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 769 aa  239  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 741 aa  237  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 763 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 720 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 726 aa  231  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 761 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 724 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 780 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 726 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 764 aa  223  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 759 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 730 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 771 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 790 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 722 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 773 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 747 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 762 aa  218  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 751 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 804 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 765 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 731 aa  216  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.71 
 
 		 754 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 771 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 728 aa  213  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  25.36 
 
 		 797 aa  212  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 722 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 736 aa  210  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 753 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 743 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 775 aa  208  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 753 aa  208  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 764 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 737 aa  208  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 729 aa  207  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 756 aa  207  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 758 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 779 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 717 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 755 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 817 aa  204  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 792 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 775 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 730 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 		 695 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 790 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 730 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 743 aa  200  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 773 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 776 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 731 aa  197  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 777 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 785 aa  197  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 794 aa  197  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 777 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 764 aa  197  8.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 784 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 782 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 771 aa  195  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 732 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 784 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  25.38 
 
 		 741 aa  194  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 773 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 773 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 806 aa  192  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 780 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 774 aa  191  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 776 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  25.44 
 
 		 809 aa  189  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 786 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 777 aa  188  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 748 aa  187  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 771 aa  186  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 726 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 780 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 725 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>