More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1766 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  48.02 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  41.27 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  38.86 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  41.36 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  36.23 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  32.32 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  29.86 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  26.17 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  30.15 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  30.15 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  28.44 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  30.88 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  25.46 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  27.51 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  26.64 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  29.95 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  33.33 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  33.33 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  29.9 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  27.64 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  26.94 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  30.22 
 
 		 533 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  27 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  26.58 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 232 aa  62  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  31.61 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  31 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  28.57 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  33.01 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  31.61 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  31.61 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  31.61 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  31.61 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  27.66 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  26.57 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  26.57 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  27.69 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  31.61 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  31.61 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  28.71 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  25.96 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  28.43 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  28.34 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  31.61 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  28.02 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  28.02 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  35.4 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  28.02 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  24.51 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  33.59 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  31.45 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  30.27 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  26.83 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  27.92 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  24.62 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  24.62 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  26.09 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0804  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  24.62 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1914  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.652638  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  31.67 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  25.28 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  28.92 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  33.63 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  24.38 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  25.45 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  31.67 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  38.3 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  31.67 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  38.3 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  31.67 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  31.67 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  38.3 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>