More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1673 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 757 aa  1526    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  44.25 
 
 		 762 aa  585  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  42.56 
 
 		 807 aa  541  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  33.93 
 
 		 785 aa  324  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 786 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 791 aa  304  5.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 763 aa  300  5e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 753 aa  300  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  32.59 
 
 		 889 aa  293  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 795 aa  293  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 802 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 781 aa  289  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 780 aa  287  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 780 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 806 aa  281  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 771 aa  273  9e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 747 aa  271  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 808 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  30.69 
 
 		 784 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 792 aa  249  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 802 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 712 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 752 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 797 aa  239  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 742 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 734 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  30.54 
 
 		 822 aa  232  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 875 aa  230  9e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 795 aa  224  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 808 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  29.83 
 
 		 856 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 777 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 766 aa  210  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 798 aa  209  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 795 aa  209  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 702 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 743 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 733 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 904 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 790 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 777 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 803 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 792 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 753 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 804 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 737 aa  187  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 724 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 788 aa  185  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 766 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 847 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 695 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 780 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 751 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 761 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 763 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 825 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 764 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 763 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 783 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 710 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 713 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 737 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  25.09 
 
 		 830 aa  173  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 704 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 771 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 853 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 720 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 700 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 730 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 732 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 795 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 731 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 851 aa  165  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  24.59 
 
 		 846 aa  164  8.000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 777 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 687 aa  161  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 703 aa  160  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 755 aa  160  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 690 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 729 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 690 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 753 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 741 aa  159  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 780 aa  157  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 775 aa  157  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 728 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.25 
 
 		 776 aa  157  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 784 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 755 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 730 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 736 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 761 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 748 aa  154  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 732 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 733 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 794 aa  153  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.93 
 
 		 715 aa  153  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 730 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 883 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 767 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>