More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1631 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 766 aa  1563    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  45.61 
 
 		 744 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  36.3 
 
 		 738 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 757 aa  345  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  32.9 
 
 		 747 aa  339  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 758 aa  320  7.999999999999999e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 789 aa  319  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 783 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 730 aa  303  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 704 aa  300  5e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  31.93 
 
 		 739 aa  300  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 807 aa  292  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 808 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 749 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 710 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 720 aa  281  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 733 aa  279  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 734 aa  279  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 812 aa  274  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 758 aa  274  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 723 aa  270  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 736 aa  270  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 732 aa  265  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 735 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 780 aa  263  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 741 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 794 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 759 aa  260  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 796 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 761 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 764 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 743 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 802 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 779 aa  247  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 790 aa  246  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 782 aa  246  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 730 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 755 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 785 aa  243  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 765 aa  240  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 751 aa  240  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 730 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 724 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 737 aa  238  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  27.52 
 
 		 797 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 747 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.52 
 
 		 754 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 743 aa  235  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 773 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 784 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 755 aa  233  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 763 aa  233  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 792 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 728 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 755 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  30.9 
 
 		 733 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 753 aa  231  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 769 aa  230  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 773 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 726 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 725 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 763 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 758 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 777 aa  228  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 771 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 743 aa  227  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 804 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 764 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 695 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 773 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 761 aa  224  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 771 aa  224  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 794 aa  223  9e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 903 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 730 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 779 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 780 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 764 aa  220  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 769 aa  220  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  26.69 
 
 		 809 aa  218  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 700 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 780 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 795 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 732 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  27.19 
 
 		 797 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 772 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 746 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 702 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 787 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 790 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 825 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 722 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 720 aa  212  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 771 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 733 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 726 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.74 
 
 		 715 aa  210  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 713 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 731 aa  210  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  26.79 
 
 		 741 aa  210  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>