More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1573 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  47.34 
 
 		 794 aa  691    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 796 aa  1609    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  43.3 
 
 		 789 aa  587  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  37.45 
 
 		 812 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  35.18 
 
 		 808 aa  425  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 829 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  33.76 
 
 		 735 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 744 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 730 aa  274  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 766 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 759 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 738 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 747 aa  237  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 783 aa  237  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 785 aa  234  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 758 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.6 
 
 		 739 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 790 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 775 aa  221  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 741 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 722 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 771 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 796 aa  214  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 737 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 794 aa  213  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 743 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 723 aa  211  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 771 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 731 aa  207  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 764 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 780 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 704 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 784 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 777 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 732 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 755 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 730 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 757 aa  201  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 792 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 785 aa  197  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 710 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 776 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 817 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  26.43 
 
 		 733 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 776 aa  196  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 761 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 726 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 832 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 790 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 746 aa  191  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 730 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 804 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 733 aa  190  9e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 765 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 745 aa  184  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 806 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 784 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 743 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 779 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 722 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 775 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 777 aa  178  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 803 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 755 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 729 aa  177  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 769 aa  177  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 773 aa  177  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 743 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  25.71 
 
 		 741 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 758 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 773 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 730 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 751 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 779 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 771 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 773 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 728 aa  171  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 797 aa  171  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  33.41 
 
 		 747 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 864 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 790 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 815 aa  169  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 726 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 764 aa  168  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 797 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 783 aa  167  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 702 aa  167  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 786 aa  167  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 761 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 779 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 734 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 896 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 758 aa  165  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 725 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 796 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 724 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 803 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 767 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 838 aa  161  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 803 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>