More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1568 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  65.41 
 
 		 489 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.68 
 
 		 482 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.94 
 
 		 480 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.26 
 
 		 482 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.79 
 
 		 483 aa  643    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.68 
 
 		 482 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  64.78 
 
 		 480 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.94 
 
 		 480 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  65.2 
 
 		 489 aa  634    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  65.41 
 
 		 489 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.57 
 
 		 480 aa  646    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  66.87 
 
 		 500 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  65.42 
 
 		 483 aa  665    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  65.41 
 
 		 489 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.31 
 
 		 480 aa  641    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.53 
 
 		 509 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  64.99 
 
 		 489 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.1 
 
 		 482 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.47 
 
 		 482 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.1 
 
 		 482 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 488 aa  979    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.1 
 
 		 482 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.75 
 
 		 484 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.42 
 
 		 488 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.52 
 
 		 480 aa  638    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.51 
 
 		 486 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.38 
 
 		 483 aa  654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  65.41 
 
 		 489 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.15 
 
 		 480 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  65.21 
 
 		 483 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.41 
 
 		 489 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  62.26 
 
 		 482 aa  634  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  62.26 
 
 		 482 aa  634  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.26 
 
 		 482 aa  634  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.89 
 
 		 482 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.05 
 
 		 482 aa  633  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.47 
 
 		 486 aa  632  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.73 
 
 		 489 aa  628  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.54 
 
 		 493 aa  628  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.7 
 
 		 485 aa  629  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.36 
 
 		 489 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.49 
 
 		 485 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.36 
 
 		 489 aa  628  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.21 
 
 		 493 aa  625  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  64.36 
 
 		 480 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.27 
 
 		 503 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.73 
 
 		 489 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.78 
 
 		 486 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.73 
 
 		 489 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.27 
 
 		 503 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.73 
 
 		 489 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.46 
 
 		 492 aa  624  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.1 
 
 		 489 aa  623  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.56 
 
 		 484 aa  624  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  63.26 
 
 		 482 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.18 
 
 		 492 aa  620  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.05 
 
 		 490 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.38 
 
 		 493 aa  617  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.58 
 
 		 486 aa  617  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.96 
 
 		 482 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4518  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.67 
 
 		 486 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.38 
 
 		 482 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.17 
 
 		 482 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.58 
 
 		 485 aa  614  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0428  succinic semialdehyde dehydrogenase  67.08 
 
 		 486 aa  613  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.75 
 
 		 482 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0833  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.46 
 
 		 486 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.405715 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.05 
 
 		 486 aa  608  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.96 
 
 		 482 aa  609  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.26 
 
 		 484 aa  608  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.08 
 
 		 479 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.88 
 
 		 483 aa  607  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.21 
 
 		 484 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  60.25 
 
 		 496 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.13 
 
 		 490 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1785  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.1 
 
 		 486 aa  600  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.08 
 
 		 490 aa  598  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3225  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.64 
 
 		 486 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00532289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.38 
 
 		 482 aa  598  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  61.04 
 
 		 491 aa  595  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.55 
 
 		 484 aa  597  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.68 
 
 		 499 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.39 
 
 		 486 aa  597  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.68 
 
 		 499 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.79 
 
 		 482 aa  598  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3095  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.86 
 
 		 491 aa  592  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.47 
 
 		 502 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.17 
 
 		 488 aa  594  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  60.88 
 
 		 482 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 		 493 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2636  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.16 
 
 		 488 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0666  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.92 
 
 		 492 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.67 
 
 		 484 aa  591  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.79 
 
 		 479 aa  585  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.25 
 
 		 500 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.38 
 
 		 484 aa  586  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.25 
 
 		 500 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  59 
 
 		 479 aa  587  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  60.88 
 
 		 482 aa  585  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.29 
 
 		 490 aa  587  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>