151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1558 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1558  fumarylacetoacetase  100 
 
 
431 aa  867    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4620  fumarylacetoacetase  56.05 
 
 
430 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4480  fumarylacetoacetase  56.28 
 
 
430 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0911  fumarylacetoacetate hydrolase  55.43 
 
 
434 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4604  fumarylacetoacetase  55.35 
 
 
430 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00921508  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1685  fumarylacetoacetase  55.84 
 
 
429 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3863  fumarylacetoacetate hydrolase  54.76 
 
 
426 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1192  fumarylacetoacetase  57.67 
 
 
435 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500062  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0818  fumarylacetoacetase  54.88 
 
 
430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3550  fumarylacetoacetase  53.43 
 
 
431 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.78252  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2463  fumarylacetoacetate hydrolase  54.5 
 
 
431 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38530  fumarylacetoacetase  55.11 
 
 
432 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000507003  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3281  fumarylacetoacetase  55.11 
 
 
432 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948022  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3332  fumarylacetoacetase  55.96 
 
 
438 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2533  fumarylacetoacetase  55.43 
 
 
436 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1045  fumarylacetoacetase  55.66 
 
 
436 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2724  fumarylacetoacetate hydrolase  50.69 
 
 
437 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801091  normal  0.0910704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4887  fumarylacetoacetase  50.23 
 
 
432 aa  412  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0412  fumarylacetoacetase  51.7 
 
 
441 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784977  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3325  fumarylacetoacetase  52.79 
 
 
431 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.736043  normal  0.102364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1118  fumarylacetoacetase  52.53 
 
 
424 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2036  fumarylacetoacetase  50.69 
 
 
438 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94384  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4303  fumarylacetoacetase  53.21 
 
 
445 aa  408  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0432  fumarylacetoacetase  54.36 
 
 
434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2044  fumarylacetoacetase  54 
 
 
431 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0798972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1123  fumarylacetoacetase  48.74 
 
 
437 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0709  fumarylacetoacetase  50.69 
 
 
438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.981478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2007  fumarylacetoacetate hydrolase  51.74 
 
 
429 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79989  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0256  fumarylacetoacetate hydrolase  51.75 
 
 
421 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0287  fumarylacetoacetase  50.34 
 
 
424 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50190  fumarylacetoacetase  51.83 
 
 
444 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2996  fumarylacetoacetate hydrolase  49.66 
 
 
425 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0100  fumarylacetoacetase  48.97 
 
 
441 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2735  fumarylacetoacetase  45.91 
 
 
429 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1794  fumarylacetoacetate hydrolase  47.36 
 
 
436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2380  fumarylacetoacetase  45.45 
 
 
440 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7461  fumarylacetoacetate hydrolase  46.54 
 
 
440 aa  352  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239921  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0995  fumarylacetoacetate hydrolase  44.95 
 
 
462 aa  350  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5612  fumarylacetoacetase  46.01 
 
 
440 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250904  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5976  fumarylacetoacetase  46.01 
 
 
440 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000358245  decreased coverage  0.000159634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3806  fumarylacetoacetase  45.93 
 
 
415 aa  336  5e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.020804  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2622  fumarylacetoacetate hydrolase  46.12 
 
 
418 aa  335  7.999999999999999e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.817563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2434  fumarylacetoacetase  45.02 
 
 
436 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0470374  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3899  fumarylacetoacetate hydrolase  45.75 
 
 
436 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2528  fumarylacetoacetate hydrolase  44.85 
 
 
450 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0781  fumarylacetoacetase  44.14 
 
 
436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477109  normal  0.394734 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3924  fumarylacetoacetate hydrolase  45.14 
 
 
422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1020  fumarylacetoacetase  43.75 
 
 
422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.406627  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1558  fumarylacetoacetase  42.99 
 
 
429 aa  319  7e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0952524  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3914  fumarylacetoacetate hydrolase  44.39 
 
 
434 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1398  fumarylacetoacetase  43.68 
 
 
435 aa  316  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0567  fumarylacetoacetate hydrolase  45.02 
 
 
424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4375  fumarylacetoacetase  43.49 
 
 
420 aa  312  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00028234  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1038  fumarylacetoacetase  42.92 
 
 
429 aa  312  5.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.318112  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0702  fumarylacetoacetase  45.12 
 
 
434 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3173  fumarylacetoacetase  44.44 
 
 
449 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2562  fumarylacetoacetase  44.44 
 
 
434 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5151  fumarylacetoacetase  42.99 
 
 
422 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389186  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01759  fumarylacetoacetase  45.08 
 
 
423 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2055  fumarylacetoacetase  44.21 
 
 
449 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0857  fumarylacetoacetase  44.21 
 
 
435 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3577  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2689  fumarylacetoacetase  44.21 
 
 
435 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1920  fumarylacetoacetase  44.21 
 
 
435 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.882274  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0719  fumarylacetoacetase  44.01 
 
 
434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118527  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3227  fumarylacetoacetase  44.91 
 
 
886 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0892  fumarylacetoacetase  43.99 
 
 
421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0821  fumarylacetoacetase  43.22 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.386558  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0790  fumarylacetoacetase  42.99 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0926  fumarylacetoacetase  42.96 
 
 
433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.523606  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3212  fumarylacetoacetase  43.75 
 
 
435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4535  fumarylacetoacetase  43.82 
 
 
423 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113775  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3463  fumarylacetoacetase  43.82 
 
 
423 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.211156 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0338  fumarylacetoacetase  42.99 
 
 
434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1436  fumarylacetoacetate hydrolase  44.39 
 
 
416 aa  306  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619546  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2109  fumarylacetoacetase  42.04 
 
 
413 aa  302  9e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0101993  normal  0.602779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0706  fumarylacetoacetase  43.94 
 
 
423 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0909  fumarylacetoacetase  42.86 
 
 
422 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3411  fumarylacetoacetase  38.44 
 
 
427 aa  299  7e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1081  fumarylacetoacetase  46.21 
 
 
420 aa  298  9e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075804  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1916  fumarylacetoacetase  42.52 
 
 
397 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00439783  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3789  fumarylacetoacetase  44.58 
 
 
398 aa  296  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10630  fumarylacetoacetate hydrolase  43.9 
 
 
412 aa  295  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499579  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1686  fumarylacetoacetase  44.23 
 
 
413 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09238  Fumarylacetoacetase  38.33 
 
 
427 aa  293  5e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0394103  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3548  fumarylacetoacetase  43.84 
 
 
401 aa  292  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.787467  normal  0.296952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1870  fumarylacetoacetase  42.28 
 
 
405 aa  292  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335153  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50281  predicted protein  42.37 
 
 
417 aa  290  3e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1109  fumarylacetoacetase  43.64 
 
 
394 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.242132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6317  fumarylacetoacetase  42.39 
 
 
390 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3811  fumarylacetoacetase  43.41 
 
 
413 aa  286  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.685186  normal  0.278222 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01896  Fumarylacetoacetase (FAA)(EC 3.7.1.2)(Fumarylacetoacetate hydrolase)(Beta-diketonase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00770]  40.05 
 
 
431 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4256  fumarylacetoacetase  42.24 
 
 
398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07020  fumarylacetoacetate hydrolase  41.9 
 
 
394 aa  283  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.257366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18890  fumarylacetoacetate hydrolase  41.03 
 
 
412 aa  280  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0251227  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0655  fumarylacetoacetate hydrolase  43.94 
 
 
391 aa  279  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6470  fumarylacetoacetase  37.74 
 
 
404 aa  260  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4686  fumarylacetoacetase  42.35 
 
 
398 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.454046  normal  0.30172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0529  fumarylacetoacetase  42.08 
 
 
401 aa  252  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8847  Fumarylacetoacetase  39.76 
 
 
378 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.768181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0090  Fumarylacetoacetase  38.82 
 
 
394 aa  226  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>