More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1497 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 246 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  47.9 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  47.06 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  43.28 
 
 		 261 aa  193  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  45.83 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  46.31 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  45.71 
 
 		 356 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  46.31 
 
 		 243 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  45.9 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  44.17 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  42.56 
 
 		 263 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  45.15 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  42.86 
 
 		 263 aa  181  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  39.83 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  42.49 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  42.68 
 
 		 318 aa  176  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  42.45 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  40.51 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  40.91 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  38.78 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  42.62 
 
 		 263 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  39.58 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  42.62 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  42.21 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  41.63 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  41.99 
 
 		 237 aa  172  5.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  39.75 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  38.37 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  40.66 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  41.39 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  39.02 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  38.21 
 
 		 241 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  39.33 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  40.08 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  42.08 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  38.21 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  38.62 
 
 		 241 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  38.78 
 
 		 263 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  40.08 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  39.68 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  38.49 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  40.17 
 
 		 241 aa  161  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  39.06 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  39.92 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  40.25 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  38.72 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  38.37 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  39.58 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  39.34 
 
 		 238 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  38.75 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  39.34 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  34.91 
 
 		 264 aa  154  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  39.83 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  39.56 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  37.92 
 
 		 239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  41.6 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  39.91 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  41.9 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  34.04 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  38.49 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  39.15 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  35.37 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  34.73 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  41.82 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  36.02 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  37.4 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  31.65 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  30.38 
 
 		 245 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  37.55 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  38.57 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  30.21 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  30.92 
 
 		 265 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  30.92 
 
 		 265 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  30.92 
 
 		 265 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  32.9 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  32.24 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  32.22 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  32.22 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  32.55 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  30.9 
 
 		 254 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  30.1 
 
 		 290 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2726  dienelactone hydrolase  32.56 
 
 		 247 aa  88.6  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  30.1 
 
 		 290 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.67 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  29.47 
 
 		 279 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  31.02 
 
 		 292 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  33.95 
 
 		 296 aa  85.5  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  33.02 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12778  hypothetical protein  32.33 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.5571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  32.33 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  28.96 
 
 		 275 aa  78.6  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  25.31 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  30.98 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  31.76 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  30.66 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  31.33 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  31.33 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2003  dienelactone hydrolase  27.16 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  27.97 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  29.69 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>