35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1431 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  348  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1737  hypothetical protein  28.83 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  29.45 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1771  hypothetical protein  27.15 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  27.01 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  27.01 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  26.24 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  27.01 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  25.18 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  32.14 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  27.14 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  27.46 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  29.79 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2879  hypothetical protein  24.11 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  24.65 
 
 		 451 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  26.67 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  26.67 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  27.78 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  27.21 
 
 		 135 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  25.19 
 
 		 133 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  25.5 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  40.74 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1028  hypothetical protein  29.35 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576295  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  27.14 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  30.66 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  25.56 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  27.41 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2209  hypothetical protein  25.75 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  27.7 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  24.18 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  26.53 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  26.62 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  30.86 
 
 		 168 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  34.33 
 
 		 147 aa  40.8  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  26.77 
 
 		 144 aa  40.4  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>