More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1408 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
309 aa  623  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  68.95 
 
 
311 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  67.97 
 
 
307 aa  420  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  59.28 
 
 
311 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  57.98 
 
 
303 aa  361  8e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  58.96 
 
 
302 aa  358  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  58.22 
 
 
308 aa  358  9e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 
312 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  56.91 
 
 
308 aa  351  8e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  57.7 
 
 
313 aa  350  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  56.72 
 
 
305 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  56.77 
 
 
312 aa  350  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  56.77 
 
 
312 aa  349  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  56.58 
 
 
308 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 
308 aa  348  9e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  56.07 
 
 
304 aa  346  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  55.41 
 
 
308 aa  346  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  54.46 
 
 
310 aa  345  4e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  55.92 
 
 
328 aa  345  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  56.39 
 
 
304 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  56.58 
 
 
313 aa  338  8e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  55.19 
 
 
319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  58.22 
 
 
308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  54.13 
 
 
317 aa  334  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  55.08 
 
 
308 aa  333  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  54.9 
 
 
309 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  54.61 
 
 
316 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  54.93 
 
 
308 aa  325  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  55.92 
 
 
314 aa  325  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  54.93 
 
 
328 aa  324  9e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  54.93 
 
 
314 aa  325  9e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  53.42 
 
 
309 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  53.9 
 
 
310 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  55.48 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  53.42 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 
308 aa  318  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  53.29 
 
 
331 aa  317  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  52.26 
 
 
307 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  51.96 
 
 
315 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  54.48 
 
 
305 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  52.63 
 
 
316 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 
312 aa  305  7e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  51.64 
 
 
316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  51.64 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  53.42 
 
 
326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  52.69 
 
 
301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  55.51 
 
 
355 aa  302  6.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
303 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 
305 aa  301  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  54.34 
 
 
305 aa  299  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 
314 aa  299  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
312 aa  298  7e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
303 aa  298  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
303 aa  297  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
320 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
298 aa  296  4e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 
303 aa  295  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
309 aa  295  5e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 
305 aa  295  7e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  53.96 
 
 
306 aa  294  1e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  52.79 
 
 
303 aa  293  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 
303 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
305 aa  293  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  53.59 
 
 
317 aa  292  5e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  48.21 
 
 
312 aa  292  6e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  50.97 
 
 
304 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
300 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  52.67 
 
 
312 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  51.13 
 
 
311 aa  288  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 
303 aa  288  6e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  51.13 
 
 
311 aa  288  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  46.25 
 
 
303 aa  288  7e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
303 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 
312 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  50.79 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 
302 aa  286  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 
302 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  50.48 
 
 
311 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  51.19 
 
 
312 aa  285  9e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  46.2 
 
 
302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  47.57 
 
 
311 aa  282  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 
301 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  46.47 
 
 
308 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 
300 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  49.64 
 
 
298 aa  280  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  51.4 
 
 
305 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 
304 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  51.4 
 
 
305 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  53.08 
 
 
306 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  48.47 
 
 
321 aa  278  7e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  47.23 
 
 
300 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  51.89 
 
 
302 aa  277  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  50.95 
 
 
309 aa  276  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  51.92 
 
 
307 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 
323 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  48.87 
 
 
309 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 
309 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  46.6 
 
 
329 aa  275  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 
310 aa  275  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>