183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1317 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1317  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  296  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559236  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1261  protein of unknown function DUF55  52.24 
 
 
139 aa  149  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5451  protein of unknown function DUF55  51.52 
 
 
137 aa  148  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.794452 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1108  hypothetical protein  49.28 
 
 
163 aa  143  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0472  hypothetical protein  50.37 
 
 
137 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.904612  normal  0.134048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0044  hypothetical protein  48.87 
 
 
137 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2368  hypothetical protein  48.53 
 
 
142 aa  141  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.864843  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2489  hypothetical protein  48.53 
 
 
142 aa  141  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016498  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0242  protein of unknown function DUF55  48.48 
 
 
138 aa  140  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0087907  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0254  protein of unknown function DUF55  48.89 
 
 
137 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0317  hypothetical protein  48.89 
 
 
137 aa  139  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2222  protein of unknown function DUF55  54.89 
 
 
147 aa  139  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.155182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1136  protein of unknown function DUF55  48.89 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115295  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3218  hypothetical protein  48.51 
 
 
144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0705  hypothetical protein  50.77 
 
 
133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2115  hypothetical protein  51.85 
 
 
138 aa  137  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1041  hypothetical protein  53.68 
 
 
141 aa  137  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0291  hypothetical protein  47.41 
 
 
137 aa  137  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0559  hypothetical protein  48.15 
 
 
137 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2173  hypothetical protein  48.51 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0082  hypothetical protein  45.11 
 
 
135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0926  protein of unknown function DUF55  46.56 
 
 
139 aa  133  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3573  hypothetical protein  47.66 
 
 
135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612442  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0468  hypothetical protein  46.67 
 
 
137 aa  130  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1748  hypothetical protein  49.61 
 
 
138 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2850  hypothetical protein  48.87 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2937  protein of unknown function DUF55  45.86 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.362763 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1331  hypothetical protein  47.33 
 
 
147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00023234  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0702  protein of unknown function DUF55  45.19 
 
 
139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0742  protein of unknown function DUF55  43.7 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0729  hypothetical protein  43.7 
 
 
140 aa  124  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.580961 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0064  protein of unknown function DUF55  48.48 
 
 
146 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1217  protein of unknown function DUF55  49.24 
 
 
137 aa  122  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.02485  hitchhiker  0.000132613 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0076  protein of unknown function DUF55  47.73 
 
 
146 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0059  hypothetical protein  49.6 
 
 
154 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1341  hypothetical protein  43.7 
 
 
141 aa  120  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000414601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0061  hypothetical protein  47.73 
 
 
146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177861  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2001  hypothetical protein  42.96 
 
 
141 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  44.38 
 
 
173 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4077  hypothetical protein  43.7 
 
 
137 aa  117  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2832  hypothetical protein  42.54 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2917  hypothetical protein  42.96 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673011  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  44.67 
 
 
163 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1512  hypothetical protein  45.86 
 
 
137 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  46.36 
 
 
156 aa  114  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_004310  BR1891  hypothetical protein  42.22 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1486  hypothetical protein  40.44 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1819  hypothetical protein  42.22 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0710947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3129  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  46.38 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0164  hypothetical protein  45.11 
 
 
141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0060  hypothetical protein  38.52 
 
 
142 aa  110  9e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3206  hypothetical protein  41.48 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162762  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0971  hypothetical protein  42.22 
 
 
144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0926  hypothetical protein  37.88 
 
 
135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0724  hypothetical protein  38.46 
 
 
132 aa  107  6e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.142066  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4141  hypothetical protein  43.38 
 
 
143 aa  107  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2318  protein of unknown function DUF55  45.75 
 
 
158 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1154  hypothetical protein  38.64 
 
 
135 aa  105  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.306462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  41.61 
 
 
158 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  41.61 
 
 
155 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000263938  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  43.71 
 
 
156 aa  103  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3412  protein of unknown function DUF55  40 
 
 
139 aa  103  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132412  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3598  hypothetical protein  40.16 
 
 
125 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289311  normal  0.0163526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3695  protein of unknown function DUF55  40.58 
 
 
143 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2962  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.481941  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0319  hypothetical protein  41.22 
 
 
149 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1853  protein of unknown function DUF55  36.24 
 
 
150 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.890211  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2196  hypothetical protein  36.24 
 
 
150 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2983  protein of unknown function DUF55  41.22 
 
 
155 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.394198 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  38.67 
 
 
152 aa  100  9e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  38.19 
 
 
152 aa  99.4  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  38.67 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4016  protein of unknown function DUF55  39.13 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69050  hypothetical protein  42 
 
 
152 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6859  protein of unknown function DUF55  37.5 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0506026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5266  hypothetical protein  39.6 
 
 
153 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561565  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0170  protein of unknown function DUF55  37.59 
 
 
131 aa  97.4  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5972  hypothetical protein  41.33 
 
 
152 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3142  hypothetical protein  41.5 
 
 
152 aa  97.1  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1312  hypothetical protein  39.87 
 
 
165 aa  95.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.29751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2770  protein of unknown function DUF55  38.51 
 
 
152 aa  94.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0051852  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5229  hypothetical protein  35.57 
 
 
149 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  36.18 
 
 
154 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1573  hypothetical protein  36.84 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000165437  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0781  protein of unknown function DUF55  35.57 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0209669  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3212  hypothetical protein  35.76 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2738  protein of unknown function DUF55  36.67 
 
 
154 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5205  hypothetical protein  37.58 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0353  hypothetical protein  39.6 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0496  protein of unknown function DUF55  37.01 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0315  hypothetical protein  34.9 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5113  hypothetical protein  36.91 
 
 
149 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839421  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3203  protein of unknown function DUF55  36.24 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5440  hypothetical protein  34.9 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00302  hypothetical protein  35.62 
 
 
156 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5031  hypothetical protein  36 
 
 
150 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02383  hypothetical protein  36.24 
 
 
156 aa  87.4  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2026  hypothetical protein  38.85 
 
 
189 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.661768  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_7562  predicted protein  42.45 
 
 
137 aa  87.4  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4320  protein of unknown function DUF55  35.62 
 
 
149 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000124301  hitchhiker  0.00573912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>