More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1309 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  100 
 
 
246 aa  497  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  67.89 
 
 
254 aa  314  7e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  52.26 
 
 
263 aa  248  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  53.53 
 
 
262 aa  248  7e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  53.06 
 
 
256 aa  245  5e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  46.64 
 
 
247 aa  208  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  44.54 
 
 
261 aa  201  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  32.76 
 
 
250 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  33.59 
 
 
249 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.26 
 
 
393 aa  93.2  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  29.18 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  30.51 
 
 
400 aa  89.4  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  26.17 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  31.52 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.97 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.51 
 
 
393 aa  87  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  28.35 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.08 
 
 
400 aa  84.7  1e-15  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  30.04 
 
 
254 aa  84.7  1e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  30.35 
 
 
251 aa  84.3  1e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  36.29 
 
 
393 aa  83.6  2e-15  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  32.14 
 
 
237 aa  82  8e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  30.98 
 
 
260 aa  82  9e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  31.23 
 
 
255 aa  81.3  1e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  31.23 
 
 
255 aa  81.3  1e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  31.23 
 
 
255 aa  81.3  1e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  31.23 
 
 
255 aa  81.3  1e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  31.23 
 
 
255 aa  81.3  1e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  31.23 
 
 
255 aa  81.3  1e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  27.85 
 
 
241 aa  81.6  1e-14  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  31.56 
 
 
253 aa  80.9  2e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  30.83 
 
 
255 aa  80.1  3e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  29.57 
 
 
254 aa  79.3  5e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.36 
 
 
400 aa  79.3  5e-14  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  28.17 
 
 
244 aa  78.6  8e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  28.45 
 
 
243 aa  77.8  2e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.46 
 
 
244 aa  76.6  3e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  31.09 
 
 
391 aa  75.1  9e-13  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  25.3 
 
 
253 aa  74.7  1e-12  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  29.53 
 
 
255 aa  74.3  2e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  33.68 
 
 
249 aa  73.9  2e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  28.03 
 
 
243 aa  74.3  2e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  28.4 
 
 
243 aa  73.9  2e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  26.77 
 
 
256 aa  74.3  2e-12  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  29.53 
 
 
255 aa  74.3  2e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.13 
 
 
255 aa  74.3  2e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  30.81 
 
 
393 aa  74.3  2e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  29.84 
 
 
255 aa  73.9  2e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  27.56 
 
 
254 aa  73.2  3e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  35.34 
 
 
247 aa  73.6  3e-12  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.74 
 
 
255 aa  73.2  3e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.64 
 
 
255 aa  73.6  3e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  34.78 
 
 
227 aa  72.8  5e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  33.91 
 
 
227 aa  72.4  7e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  25.38 
 
 
263 aa  71.6  1e-11  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  35.14 
 
 
522 aa  71.6  1e-11  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  28.99 
 
 
397 aa  71.2  1e-11  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.75 
 
 
223 aa  71.6  1e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
596 aa  70.9  2e-11  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  38.74 
 
 
251 aa  70.5  2e-11  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.89238e-05 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  27.84 
 
 
270 aa  70.9  2e-11  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  29.48 
 
 
263 aa  71.2  2e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.35 
 
 
255 aa  70.5  2e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  33.61 
 
 
383 aa  69.3  6e-11  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  22.62 
 
 
249 aa  68.2  1e-10  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  7.72544e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  29.41 
 
 
300 aa  68.2  1e-10  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.94318e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  31.22 
 
 
222 aa  67.8  2e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  34.43 
 
 
384 aa  67  2e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  25.88 
 
 
400 aa  65.9  5e-10  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.5 
 
 
397 aa  65.9  5e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  26.94 
 
 
436 aa  66.2  5e-10  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  34.78 
 
 
388 aa  66.2  5e-10  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  27 
 
 
397 aa  65.9  6e-10  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  34.96 
 
 
237 aa  65.5  7e-10  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  27.05 
 
 
243 aa  65.1  1e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  24.05 
 
 
247 aa  64.7  1e-09  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  1.4669e-07 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.23 
 
 
405 aa  65.1  1e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  36.52 
 
 
234 aa  65.1  1e-09  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  36.84 
 
 
230 aa  64.7  1e-09  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  32.08 
 
 
225 aa  64.3  2e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
220 aa  64.3  2e-09  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.81 
 
 
428 aa  64.3  2e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  32.08 
 
 
225 aa  64.3  2e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.99 
 
 
224 aa  64.3  2e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  27.75 
 
 
393 aa  64.3  2e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  32.08 
 
 
225 aa  63.9  2e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  36.84 
 
 
230 aa  64.3  2e-09  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  1.62703e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  28.03 
 
 
243 aa  64.3  2e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  36.13 
 
 
225 aa  63.2  3e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  49.21 
 
 
245 aa  63.2  3e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  29.11 
 
 
392 aa  63.5  3e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  45.33 
 
 
232 aa  63.2  4e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  25.39 
 
 
256 aa  63.2  4e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  32.49 
 
 
237 aa  62.8  4e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  30.97 
 
 
240 aa  62.8  5e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  40 
 
 
232 aa  62.8  5e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  32.28 
 
 
384 aa  62.4  6e-09  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  34.78 
 
 
225 aa  62.4  7e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  33.62 
 
 
243 aa  62  9e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  26.05 
 
 
243 aa  62  9e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  2.88771e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>