More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1259 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1259  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 334 aa  682    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2919  OmpA/MotB  56.88 
 
 		 287 aa  305  7e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  40.26 
 
 		 298 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1244  flagellar motor protein MotB  37.21 
 
 		 319 aa  185  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1000  OmpA/MotB domain-containing protein  37.64 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1036  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1843  OmpA/MotB  36.22 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3184  flagellar motor protein MotB  38.71 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12888  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3817  flagellar motor protein MotB  37.99 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3938  flagellar motor protein MotB  39.07 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249786  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0079  flagellar motor protein MotB  39.07 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3857  flagellar motor protein MotB  39.07 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.347462  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2976  flagellar motor protein MotB  35.84 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0117  flagellar motor protein MotB  36.62 
 
 		 335 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0163  flagellar motor protein MotB  35.29 
 
 		 338 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724048  normal  0.748844 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  37.01 
 
 		 339 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0236  flagellar motor protein MotB  36.65 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2853  flagellar motor protein MotB  36.65 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0254  flagellar motor protein MotB  36.65 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3356  flagellar motor protein MotB  36.88 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828163  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2791  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.88 
 
 		 318 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3226  OmpA/MotB domain protein  40.42 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0410363  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  36.65 
 
 		 339 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0723  flagellar motor protein MotB  36.56 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1434  OmpA/MotB  34.27 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2873  chemotaxis signal transduction protein CheY  37.05 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1978  OmpA/MotB domain-containing protein  35.82 
 
 		 286 aa  165  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0364656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3703  OmpA/MotB  35.02 
 
 		 314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0603  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  35.64 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1555  OmpA/MotB domain-containing protein  35.93 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00240809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  34.97 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1308  flagellar motor protein MotB  33.56 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3089  OmpA/MotB domain protein  34.49 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5983  OmpA/MotB domain protein  37.71 
 
 		 329 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1321  chemotaxis MotB protein  33.57 
 
 		 290 aa  159  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  34.06 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  33.8 
 
 		 313 aa  155  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4422  OmpA/MotB domain-containing protein  34.27 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.66197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  36.98 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5607  flagellar motor protein MotB  35.29 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707499  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2938  OmpA/MotB  37.98 
 
 		 279 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.443593 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2267  flagellar motor protein MotB  33.8 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03067  flagellar motor protein MotB  34.74 
 
 		 377 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2239  flagellar motor protein MotB  33.45 
 
 		 312 aa  149  9e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0438  flagellar motor protein MotB  32.99 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2735  flagellar motor protein-like protein  38.46 
 
 		 278 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.867808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2778  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4204  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2826  flagellar motor protein MotB  34.66 
 
 		 421 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.156984 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1748  flagellar motor protein MotB  34.91 
 
 		 451 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.540445  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1637  flagellar motor protein MotB  34.66 
 
 		 433 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0625  flagellar motor protein MotB  34.69 
 
 		 329 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1539  flagellar motor protein MotB  34.18 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1504  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.962914  normal  0.610699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0562  flagellar motor protein MotB  33.95 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  36.46 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2640  OmpA/MotB domain-containing protein  33.7 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  hitchhiker  0.00000281667 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1511  flagellar motor protein MotB  34.31 
 
 		 377 aa  142  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0155028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2986  OmpA/MotB domain-containing protein  32.6 
 
 		 321 aa  142  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3380  chemotaxis protein MotB  37.19 
 
 		 272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65430  flagellar motor protein MotB  35.64 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  32.6 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  32.6 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4952  chemotaxis motB protein  33.21 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1322  flagellar motor protein MotB  32.6 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.300198  hitchhiker  5.1879400000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2138  flagellar motor protein MotB  32.6 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  hitchhiker  1.07849e-26 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2078  flagellar motor protein MotB  32.6 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000517437  hitchhiker  0.0000035 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2962  putative chemotaxis MotB protein  37.27 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1302  putative chemotaxis MotB protein  37.27 
 
 		 278 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01860  flagellar motor protein MotB  30.37 
 
 		 308 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0228996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1751  OmpA/MotB domain protein  30.37 
 
 		 308 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0290183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4696  flagellar motor protein MotB  36.03 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1743  flagellar motor protein MotB  30.37 
 
 		 308 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0513  flagellar motor protein MotB  33.97 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1985  flagellar motor protein MotB  30.37 
 
 		 308 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000595029  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4157  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2628  flagellar motor protein MotB  30.37 
 
 		 308 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00566133  hitchhiker  0.0000000000155511 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01849  hypothetical protein  30.37 
 
 		 308 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0472674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1295  flagellar motor protein MotB  30.37 
 
 		 308 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00197011  hitchhiker  0.000000685167 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2122  flagellar motor protein MotB  30.37 
 
 		 308 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245861  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0055  OmpA/MotB domain-containing protein  29.9 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3688  flagellar motor protein MotB  35.62 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2695  putative chemotaxis MotB protein  37.59 
 
 		 266 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1410  flagellar motor protein MotB  33.72 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4158  flagellar motor protein MotB  31.87 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4046  flagellar motor protein MotB  31.87 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.475556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2025  OmpA/MotB  32.34 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0231038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0284  hypothetical protein  30.69 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.179878  normal  0.584147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4904  flagellar motor protein MotB  36.13 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4957  flagellar motor protein MotB  32.03 
 
 		 350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3350  hypothetical protein  30.74 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.935106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4780  flagellar motor protein MotB  35.04 
 
 		 346 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0226  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 		 346 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174216  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4172  chemotaxis protein MotB  37.91 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2467  flagellar motor protein MotB  30.94 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0620427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0193  OmpA/MotB domain-containing protein  31.4 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0049  OmpA/MotB  28.76 
 
 		 336 aa  125  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1997  OmpA/MotB domain protein  33.21 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1854  OmpA/MotB domain protein  34.52 
 
 		 350 aa  122  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00497305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>