285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1255 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1255  dithiobiotin synthetase  100 
 
 		 209 aa  407  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.52735 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  65.7 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  62.32 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  62.44 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  62.8 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4343  dithiobiotin synthetase  65.22 
 
 		 213 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0906504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  59.52 
 
 		 210 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  60.87 
 
 		 213 aa  235  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  56.04 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  56.25 
 
 		 212 aa  225  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  56.25 
 
 		 212 aa  225  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  58.94 
 
 		 202 aa  221  7e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3319  dithiobiotin synthetase  63.77 
 
 		 212 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  59.9 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2918  dithiobiotin synthetase  57.44 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295464  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  46.97 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  40.91 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  40.91 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  41.75 
 
 		 242 aa  164  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  46.84 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  44.55 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  38.1 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  43.59 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  37.57 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  36.51 
 
 		 221 aa  151  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  47.21 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  40.31 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  45.81 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05390  dethiobiotin synthetase  40 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  37.57 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  40.82 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  40.21 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  42.55 
 
 		 474 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  41.54 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  37.17 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2977  dethiobiotin synthetase  43.58 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1690  dethiobiotin synthase  38.8 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.439314  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  39.78 
 
 		 217 aa  119  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  33.9 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1390  dethiobiotin synthetase  39.22 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0353  dethiobiotin synthetase  34.38 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.789555  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0330  dethiobiotin synthetase  34.38 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  31.25 
 
 		 249 aa  98.6  7e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1658  dethiobiotin synthetase  33.16 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0083  dethiobiotin synthase  34.32 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  38.1 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  34.51 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  39.22 
 
 		 244 aa  91.7  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  38.14 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  37.71 
 
 		 646 aa  91.3  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  38.07 
 
 		 264 aa  88.6  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  34.54 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  29.55 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  33.02 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  40.72 
 
 		 263 aa  86.7  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  35.15 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  34.58 
 
 		 241 aa  86.3  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  38.82 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  31.88 
 
 		 239 aa  85.1  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  34.16 
 
 		 242 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  34.06 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  33.17 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  29.35 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  30.85 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  35.29 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  32.58 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  34.91 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  33.01 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  34.17 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  33.67 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  34.3 
 
 		 234 aa  81.3  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  33.66 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  33.66 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  32.14 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  37.06 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  33.66 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  32.14 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  25.23 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  33.66 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  34.48 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  36.42 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  33.91 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  38.01 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  30.57 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  38.01 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  34.26 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  34.42 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2663  dethiobiotin synthase  35.07 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  28.7 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  33.01 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  32.14 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  32.85 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0116  dithiobiotin synthetase  33.64 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  34.3 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  34.29 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  32.54 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  28.99 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  32.54 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  32.54 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>