75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1117 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  100 
 
 
313 aa  630  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  34.26 
 
 
330 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.68 
 
 
361 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.59 
 
 
350 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.25 
 
 
350 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  24.76 
 
 
565 aa  90.1  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1811  hypothetical protein  31.63 
 
 
642 aa  84.3  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185715  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  29.93 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39120  hypothetical protein  31.33 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00513866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  24.81 
 
 
543 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  27.65 
 
 
605 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  29.13 
 
 
568 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  27.88 
 
 
607 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  26.06 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  29.49 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  26.59 
 
 
567 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  28.85 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  28.46 
 
 
551 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  22.95 
 
 
542 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  26.91 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  32.64 
 
 
547 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  28.57 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  27.03 
 
 
572 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  29.55 
 
 
546 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  35.29 
 
 
568 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  25.7 
 
 
309 aa  62.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  26.8 
 
 
569 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  24.83 
 
 
600 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  24.83 
 
 
600 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  27.03 
 
 
572 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  28.68 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  24.13 
 
 
571 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  28.15 
 
 
365 aa  60.1  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  24.32 
 
 
601 aa  59.3  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  23.32 
 
 
570 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  25.62 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  29.09 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.11 
 
 
406 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  27.62 
 
 
533 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  34.59 
 
 
567 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  27.31 
 
 
545 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.36 
 
 
488 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  27.24 
 
 
319 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  28.57 
 
 
526 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  28.29 
 
 
410 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  25.87 
 
 
324 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.77 
 
 
505 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  27.4 
 
 
343 aa  52.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  29.82 
 
 
498 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  31.54 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  31.43 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  31.49 
 
 
300 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  25.15 
 
 
369 aa  49.3  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  27.27 
 
 
372 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  26.44 
 
 
456 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  25 
 
 
456 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  24 
 
 
345 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  26.38 
 
 
369 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  34.48 
 
 
341 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  25.96 
 
 
348 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  24.45 
 
 
382 aa  46.6  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  24.23 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  24.24 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  26.87 
 
 
498 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  26.5 
 
 
373 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  25.11 
 
 
464 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  32.82 
 
 
410 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  25.61 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  24.67 
 
 
347 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.36 
 
 
382 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  32.62 
 
 
476 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  28.33 
 
 
327 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  25.14 
 
 
526 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1449  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.49 
 
 
436 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  28.48 
 
 
318 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>