More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1112 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
656 aa  1341    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.68 
 
 
662 aa  276  9e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.68 
 
 
662 aa  276  9e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.53 
 
 
662 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.91 
 
 
662 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.27 
 
 
644 aa  273  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.05 
 
 
645 aa  267  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.43 
 
 
645 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  29.95 
 
 
645 aa  266  7e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.58 
 
 
645 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.77 
 
 
645 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.91 
 
 
654 aa  257  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.31 
 
 
654 aa  256  9e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.47 
 
 
661 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.78 
 
 
634 aa  253  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.92 
 
 
659 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  29.19 
 
 
662 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.62 
 
 
661 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.49 
 
 
662 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  28.83 
 
 
649 aa  236  8e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.75 
 
 
657 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.9 
 
 
653 aa  234  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  29.07 
 
 
642 aa  233  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.74 
 
 
665 aa  224  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.77 
 
 
654 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  30.5 
 
 
655 aa  221  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  27.7 
 
 
653 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.8 
 
 
645 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  31.74 
 
 
646 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.24 
 
 
632 aa  211  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  29.08 
 
 
640 aa  210  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.13 
 
 
642 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  25.73 
 
 
648 aa  208  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.66 
 
 
623 aa  207  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.89 
 
 
649 aa  204  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.15 
 
 
907 aa  203  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.97 
 
 
662 aa  203  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.89 
 
 
665 aa  202  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.01 
 
 
705 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.6 
 
 
650 aa  201  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.79 
 
 
755 aa  200  7.999999999999999e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.07 
 
 
644 aa  197  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.27 
 
 
685 aa  196  8.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.3 
 
 
656 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.08 
 
 
688 aa  195  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.46 
 
 
924 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.3 
 
 
655 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.63 
 
 
630 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.5 
 
 
652 aa  186  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.23 
 
 
632 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  27.34 
 
 
636 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.35 
 
 
706 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.48 
 
 
665 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  34.26 
 
 
759 aa  171  5e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.15 
 
 
629 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  25.8 
 
 
665 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  29.53 
 
 
681 aa  164  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  33.99 
 
 
634 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.16 
 
 
686 aa  161  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.89 
 
 
641 aa  160  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.03 
 
 
682 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.64 
 
 
626 aa  157  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.59 
 
 
686 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.36 
 
 
631 aa  156  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.6 
 
 
629 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.39 
 
 
666 aa  151  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.8 
 
 
626 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2873  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.61 
 
 
677 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.78 
 
 
688 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.62 
 
 
626 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.77 
 
 
642 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.99 
 
 
646 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.48 
 
 
626 aa  146  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.48 
 
 
626 aa  146  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  25.91 
 
 
694 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.46 
 
 
629 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.94 
 
 
636 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.41 
 
 
650 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0061  prolyl oligopeptidase family protein  29.85 
 
 
653 aa  141  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101557  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.81 
 
 
731 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2498  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  27.61 
 
 
867 aa  134  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0495  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.01 
 
 
692 aa  134  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.468891  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.47 
 
 
632 aa  127  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.73 
 
 
575 aa  120  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28 
 
 
675 aa  118  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.453566  normal  0.217574 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.95 
 
 
615 aa  118  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.62 
 
 
596 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.1 
 
 
655 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  28.72 
 
 
678 aa  115  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.76 
 
 
652 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.17 
 
 
635 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0668  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.73 
 
 
719 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.37275  normal  0.141297 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.8 
 
 
612 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1335  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.34 
 
 
643 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.42 
 
 
594 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.33 
 
 
621 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  28.75 
 
 
649 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.92 
 
 
656 aa  111  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.14 
 
 
682 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.99 
 
 
628 aa  110  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>