More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1094 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0933  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  56.82 
 
 
668 aa  710    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.115287  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1094  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
680 aa  1373    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.764126  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0184  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  52.28 
 
 
698 aa  630  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1911  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  47.74 
 
 
683 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000149858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2039  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  47.38 
 
 
683 aa  610  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.033765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2374  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  47.6 
 
 
683 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000964211  normal  0.238818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3102  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  48.14 
 
 
700 aa  600  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.245762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2155  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  46.72 
 
 
686 aa  598  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000413371  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1919  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  47.46 
 
 
682 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000323792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2696  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  46.94 
 
 
720 aa  597  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.8559  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1091  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  46.95 
 
 
692 aa  598  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  47.46 
 
 
683 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000205903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  47.46 
 
 
683 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000111098  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2357  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  45.97 
 
 
684 aa  594  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000735182  hitchhiker  0.000512118 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1808  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  45.67 
 
 
687 aa  587  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0881  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  45.15 
 
 
709 aa  585  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1689  peptidase, putative  45.72 
 
 
684 aa  585  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163482  normal  0.0910098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2223  peptidase, putative  46.28 
 
 
687 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2123  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  45.54 
 
 
687 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000494152  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2199  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  45.68 
 
 
687 aa  581  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000634977  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  45.54 
 
 
687 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000361808  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2228  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  45.53 
 
 
684 aa  580  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0618866  hitchhiker  0.00768249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1905  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  45.93 
 
 
685 aa  581  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82841  hitchhiker  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1455  alanyl dipeptidyl peptidase  44.2 
 
 
717 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1385  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  43.7 
 
 
688 aa  571  1e-161  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02099  alanyl dipeptidyl peptidase  43.98 
 
 
713 aa  566  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4796  hypothetical protein  37.46 
 
 
695 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  39.79 
 
 
674 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.94 
 
 
674 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.49 
 
 
674 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0118  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.52 
 
 
687 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125913  normal  0.195999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4193  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  34.28 
 
 
688 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259535  normal  0.164737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  33.58 
 
 
688 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.33 
 
 
673 aa  339  8e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00800  peptidase, putative  34.23 
 
 
750 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.05 
 
 
698 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.35 
 
 
698 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.76 
 
 
673 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  32.24 
 
 
675 aa  324  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.61 
 
 
675 aa  324  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0591  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.08 
 
 
675 aa  323  9.000000000000001e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02572  hypothetical dipeptidyl-peptidase (Eurofung)  36.22 
 
 
722 aa  319  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459981  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.9 
 
 
681 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  30.59 
 
 
648 aa  318  2e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.9 
 
 
681 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.75 
 
 
681 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.54 
 
 
675 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.5 
 
 
680 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.58 
 
 
681 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.67 
 
 
690 aa  299  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0581677 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10198  oligopeptidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04730)  32.62 
 
 
729 aa  298  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0636  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.26 
 
 
633 aa  297  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.52 
 
 
633 aa  296  7e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.84 
 
 
672 aa  266  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3158  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.96 
 
 
668 aa  257  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.03 
 
 
688 aa  253  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1462  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.28 
 
 
680 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.82 
 
 
700 aa  241  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.955873  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.16 
 
 
695 aa  237  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.48 
 
 
666 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.533433  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.89 
 
 
666 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0779604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3633  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.89 
 
 
666 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  29.99 
 
 
697 aa  230  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.37 
 
 
678 aa  230  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6776  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.05 
 
 
661 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3954  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.47 
 
 
694 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.871148  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.34 
 
 
673 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.35 
 
 
704 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0880846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01350  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  30.54 
 
 
721 aa  217  5e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0333  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.56 
 
 
717 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.15 
 
 
670 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.47 
 
 
668 aa  210  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0169  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.53 
 
 
709 aa  199  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.55 
 
 
652 aa  196  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3949  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.36 
 
 
716 aa  192  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782575  normal  0.167111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.82 
 
 
667 aa  190  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.43 
 
 
720 aa  188  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28910  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  30.91 
 
 
719 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487032  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.95 
 
 
695 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.62 
 
 
766 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.51 
 
 
726 aa  173  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.52 
 
 
686 aa  173  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.61 
 
 
677 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1818  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.74 
 
 
692 aa  167  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0201758  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.82 
 
 
660 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24510  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  25.69 
 
 
712 aa  158  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.64 
 
 
708 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.93 
 
 
682 aa  157  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  24.57 
 
 
656 aa  155  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  24.6 
 
 
656 aa  154  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.52 
 
 
617 aa  150  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1114  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.34 
 
 
701 aa  150  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00579  putative peptidase  24.03 
 
 
704 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0732  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.61 
 
 
626 aa  146  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.517111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2192  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.05 
 
 
701 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0268398  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.32 
 
 
631 aa  144  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.18 
 
 
692 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0490  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  25.24 
 
 
729 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.37 
 
 
762 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  29.51 
 
 
648 aa  137  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>