More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1087 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0072  transferase  58.66 
 
 		 187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2735  acetyltransferase  55.68 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  54.17 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  54.17 
 
 		 175 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  53.57 
 
 		 175 aa  191  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  48.21 
 
 		 174 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2420  hexapaptide repeat-containing transferase  57.62 
 
 		 189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  49.12 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  47.46 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1520  hexapaptide repeat-containing transferase  51.79 
 
 		 175 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000102664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1678  carbonic anhydrase  47.33 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  49.15 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0223  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453095  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0466  hexapeptide transferase family protein  44.31 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  49.13 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1498  carbonic anhydrase  48.3 
 
 		 180 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1066  hexapeptide transferase family protein  43.45 
 
 		 170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  46.2 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0045  hexapeptide transferase family protein  41.57 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0961185  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  46.99 
 
 		 184 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00380  hypothetical protein  46.99 
 
 		 183 aa  160  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  47.16 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  46.2 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00032  putative carbonic anhydrase/acetyltransferase  45.51 
 
 		 180 aa  158  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00477036  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  45.03 
 
 		 177 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  46.39 
 
 		 182 aa  158  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000548613  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3658  acetyltransferase/carbonic anhydrase  48.25 
 
 		 175 aa  157  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  42.13 
 
 		 182 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000072443  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  42.13 
 
 		 182 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000433363  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2138  transferase hexapeptide repeat containing protein  46.71 
 
 		 180 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0041  carbonic anhydrase  42.37 
 
 		 182 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000411727  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0037  carbonic anhydrase  42.37 
 
 		 182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198121  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0042  carbonic anhydrase  42.37 
 
 		 182 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000454133  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0042  carbonic anhydrase  41.57 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0249  acetyltransferase  45.61 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0290  acetyltransferase  43.93 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0175113 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0041  carbonic anhydrase, family 3  41.81 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508164  unclonable  0.00000000000448586 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0858  hexapaptide repeat-containing transferase  41.42 
 
 		 172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0045  carbonic anhydrase  39.77 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000362772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0045  carbonic anhydrase  41.57 
 
 		 182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.0000010839 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0280  hexapaptide repeat-containing transferase  38.82 
 
 		 182 aa  151  4e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.801626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4073  acetyltransferase/carbonic anhydrase  45.39 
 
 		 175 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.213476  hitchhiker  0.00780432 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0034  carbonic anhydrase  41.24 
 
 		 182 aa  151  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000602369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  42.01 
 
 		 174 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0033  carbonic anhydrase/acetyltransferase  43.98 
 
 		 177 aa  150  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000120925  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0254  hexapaptide repeat-containing transferase  38.24 
 
 		 182 aa  150  8e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.836815  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1936  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  45.4 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  47.37 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0036  carbonic anhydrase  42.29 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906421  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  41.07 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1414  transferase hexapeptide repeat containing protein  47.55 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000109876  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  46.2 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0228  hexapaptide repeat-containing transferase  38.82 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  40.96 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0401  anhydrase family 3 protein  43.98 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2116  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  43.6 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  43.02 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0426  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  42.76 
 
 		 176 aa  147  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  43.4 
 
 		 182 aa  147  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  47.1 
 
 		 163 aa  147  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  42.01 
 
 		 174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  42.01 
 
 		 174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2271  acetyltransferase  42.86 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  41.28 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000022748  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  41.28 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  47.4 
 
 		 180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  46.06 
 
 		 180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  45.45 
 
 		 180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0042  carbonic anhydrase  38.89 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000058127  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 		 180 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  44.44 
 
 		 182 aa  144  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  42.53 
 
 		 189 aa  144  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1929  hexapaptide repeat-containing transferase  42.17 
 
 		 182 aa  144  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000963233  hitchhiker  0.00946276 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  39.31 
 
 		 179 aa  144  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0870  transferase  40.35 
 
 		 187 aa  144  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  38.32 
 
 		 173 aa  144  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0095  anhydrase family 3 protein  44.44 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1604  hexapaptide repeat-containing transferase  41.57 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2541  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  42.77 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  45.18 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0110  carbonic anhydrase  44.44 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0989  transferase  39.77 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0110  transferase  44.44 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0030  anhydrase family 3 protein  41.52 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0319  hexapaptide repeat-containing transferase  41.11 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0037  carbonic anhydrase  38.76 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000544891  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4505  putative transferase  41.52 
 
 		 180 aa  141  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187962  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  42.11 
 
 		 180 aa  141  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0053  anhydrase family 3 protein  43.37 
 
 		 179 aa  141  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0054  carbonic anhydrase  36.93 
 
 		 182 aa  141  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000373213  normal  0.14059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  44.17 
 
 		 174 aa  141  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  43.27 
 
 		 182 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0085  putative transferase  40.36 
 
 		 181 aa  140  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000367586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5080  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  40.72 
 
 		 170 aa  140  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186899 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  37.63 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000121267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  37.63 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000608739  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  37.63 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3473  hypothetical protein  37.63 
 
 		 256 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.93281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  41.21 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>