More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1012 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
264 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.3 
 
 
269 aa  296  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  57.69 
 
 
265 aa  286  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.23 
 
 
268 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.46 
 
 
268 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610166  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.1 
 
 
263 aa  266  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.94 
 
 
268 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.177848  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7120  enoyl-CoA hydratase  58.17 
 
 
268 aa  258  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524105 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.56 
 
 
262 aa  240  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.91 
 
 
290 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0802  enoyl-CoA hydratase  47.83 
 
 
265 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 
265 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.08 
 
 
259 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.59 
 
 
259 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.46 
 
 
259 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
255 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 
277 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 
277 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1281  enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 
259 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436813  normal  0.258373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  40.8 
 
 
277 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1945  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.59 
 
 
259 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.59 
 
 
259 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1852  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.47 
 
 
292 aa  152  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.178137  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1271  enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 
259 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1254  enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 
259 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497005  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3671  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.3 
 
 
270 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222847  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2741  enoyl-CoA hydratase  40.94 
 
 
276 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.411296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0290  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
267 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926213  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  39.39 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11500  enoyl-CoA hydratase  38.21 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.708034  normal  0.0989201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
277 aa  138  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3669  enoyl-CoA hydratase  41.26 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517909  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  39.46 
 
 
263 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  38.64 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
264 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0279  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 
262 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4886  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
269 aa  128  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  37.56 
 
 
270 aa  128  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0026  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1610  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
266 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
259 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7165  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85548  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
260 aa  125  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
264 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.87 
 
 
252 aa  125  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  36.7 
 
 
288 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
268 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3098  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
272 aa  125  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
260 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 
269 aa  125  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  34.27 
 
 
283 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
263 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2277  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
272 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 
264 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.82 
 
 
263 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2682  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 
278 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.189349  normal  0.255718 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
274 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 
264 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 
263 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
261 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
263 aa  123  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.59 
 
 
267 aa  123  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.7 
 
 
256 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
267 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.96 
 
 
662 aa  122  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
254 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.94 
 
 
662 aa  122  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 
269 aa  122  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
267 aa  122  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  28.68 
 
 
262 aa  121  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.08 
 
 
662 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.29 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.08 
 
 
659 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.38 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 
261 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
276 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.32 
 
 
267 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
266 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  34.3 
 
 
283 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
294 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.55 
 
 
258 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>