More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1011 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  60.81 
 
 
296 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  63.18 
 
 
296 aa  361  6e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  61.49 
 
 
309 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  61.49 
 
 
296 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 
301 aa  342  5e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  56.31 
 
 
294 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  57 
 
 
289 aa  328  9e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  53.54 
 
 
290 aa  321  9.999999999999999e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  59.93 
 
 
291 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  56.52 
 
 
293 aa  309  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.55 
 
 
297 aa  309  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  53.27 
 
 
307 aa  305  8.000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  60.34 
 
 
299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  52.25 
 
 
298 aa  263  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.35 
 
 
282 aa  252  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  47.39 
 
 
291 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.43 
 
 
290 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1856  enoyl-CoA hydratase  49.15 
 
 
288 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  43.96 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  50.17 
 
 
288 aa  232  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3638  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.16 
 
 
293 aa  232  7.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  41.91 
 
 
285 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  41.91 
 
 
285 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  41.91 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.83 
 
 
274 aa  179  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00370  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01890)  37.11 
 
 
291 aa  178  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.526484  normal  0.612902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
275 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  38.16 
 
 
270 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 
271 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.41 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.78 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 
270 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.13 
 
 
260 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 
270 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 
271 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.77 
 
 
269 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
270 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  37.09 
 
 
264 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.17 
 
 
274 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 
268 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 
265 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
281 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
282 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 
267 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
294 aa  142  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  34.41 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  37.88 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
276 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  36.7 
 
 
281 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
264 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 
265 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  36.7 
 
 
281 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
263 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  36.3 
 
 
267 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.06 
 
 
263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.62 
 
 
266 aa  136  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  34.83 
 
 
257 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.33 
 
 
260 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.54 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.63 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.17 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.13 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.62 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.73 
 
 
259 aa  133  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.06 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.94 
 
 
258 aa  132  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  35.96 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.53 
 
 
273 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  38.97 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
263 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.09 
 
 
257 aa  129  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
268 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.47 
 
 
262 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
264 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.09 
 
 
260 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.3 
 
 
278 aa  128  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.27 
 
 
661 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  34.43 
 
 
663 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0802  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.42 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.27 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>