114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0971 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0971  Asp/Glu racemase  100 
 
 
246 aa  497  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0912948  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3417  Asp/Glu racemase  59.75 
 
 
252 aa  289  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  57.61 
 
 
250 aa  284  1e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4294  Asp/Glu racemase  54.1 
 
 
252 aa  242  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2031  putative hydantoin racemase  35.63 
 
 
252 aa  136  3e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.73 
 
 
248 aa  88.6  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  33.67 
 
 
249 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.71 
 
 
256 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.38 
 
 
245 aa  84.3  1e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.38 
 
 
245 aa  84.3  1e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  31.44 
 
 
245 aa  84.7  1e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.7 
 
 
251 aa  82.4  6e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  30.21 
 
 
245 aa  82  7e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  29.08 
 
 
254 aa  78.6  9e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  29.38 
 
 
243 aa  78.6  9e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  29.67 
 
 
248 aa  78.6  1e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3252  hypothetical protein  33.33 
 
 
276 aa  78.2  1e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  28.91 
 
 
243 aa  77  2e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  28.43 
 
 
243 aa  75.5  7e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  28.23 
 
 
239 aa  75.1  1e-12  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  29.95 
 
 
247 aa  75.1  1e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.71 
 
 
250 aa  73.9  2e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.78 
 
 
245 aa  73.6  3e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.16 
 
 
250 aa  73.6  3e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.5 
 
 
247 aa  72  8e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  28.22 
 
 
238 aa  72  8e-12  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.63 
 
 
245 aa  71.6  1e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  32.12 
 
 
241 aa  70.9  2e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1959  hypothetical protein  27.89 
 
 
245 aa  70.9  2e-11  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5610  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.89 
 
 
247 aa  70.9  2e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  27.03 
 
 
243 aa  69.7  4e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  31.02 
 
 
243 aa  69.7  4e-11  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1965  hypothetical protein  27.89 
 
 
245 aa  69.7  4e-11  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.43 
 
 
247 aa  69.3  6e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.54 
 
 
245 aa  68.9  6e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  25.55 
 
 
234 aa  68.6  9e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  32.53 
 
 
247 aa  67.8  1e-10  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  31.61 
 
 
229 aa  68.2  1e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3382  hydantoin racemase  31.37 
 
 
229 aa  68.2  1e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.8 
 
 
244 aa  67.8  2e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.02 
 
 
240 aa  67  3e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2076  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.58 
 
 
245 aa  66.2  4e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.491688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  29.06 
 
 
261 aa  66.2  5e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.27 
 
 
244 aa  65.9  6e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  31.71 
 
 
242 aa  65.5  8e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.53 
 
 
252 aa  65.1  1e-09  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1556  Asp/Glu racemase  32.59 
 
 
267 aa  64.7  1e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.71 
 
 
242 aa  64.7  1e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  28.57 
 
 
242 aa  64.7  1e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  29.08 
 
 
258 aa  64.7  1e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.64 
 
 
245 aa  64.3  2e-09  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  34.13 
 
 
279 aa  63.9  2e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  31.36 
 
 
242 aa  63.2  3e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  26.77 
 
 
236 aa  63.5  3e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  31.36 
 
 
242 aa  63.2  3e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.1 
 
 
242 aa  63.2  4e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  29.02 
 
 
240 aa  63.2  4e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  30.13 
 
 
243 aa  62.8  5e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  27.27 
 
 
263 aa  62.8  5e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.31 
 
 
285 aa  62.8  5e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.17 
 
 
226 aa  62.8  5e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  27.27 
 
 
263 aa  62.8  5e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  30.77 
 
 
240 aa  62.4  6e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.41 
 
 
250 aa  62.4  6e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  30.77 
 
 
240 aa  62.4  6e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.77 
 
 
240 aa  62.4  7e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.27 
 
 
263 aa  62  8e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  27.27 
 
 
279 aa  62  8e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  29.09 
 
 
232 aa  61.2  1e-08  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.42 
 
 
278 aa  61.2  1e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4489  hypothetical protein  25.35 
 
 
262 aa  61.6  1e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  26.79 
 
 
263 aa  61.2  1e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.45 
 
 
278 aa  61.2  2e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  28.19 
 
 
288 aa  60.8  2e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3409  hypothetical protein  32.39 
 
 
219 aa  60.5  2e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3273  Asp/Glu racemase  31.82 
 
 
251 aa  60.8  2e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325881  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  26.67 
 
 
327 aa  60.5  2e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  26.67 
 
 
318 aa  60.8  2e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.19 
 
 
288 aa  60.5  3e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6268  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.4 
 
 
262 aa  60.1  3e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  26.67 
 
 
280 aa  60.1  3e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4863  Hydantoin racemase-like protein  27.07 
 
 
259 aa  59.7  4e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278835  normal  0.546582 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  26.67 
 
 
280 aa  59.7  4e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  26.67 
 
 
280 aa  59.7  4e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  26.5 
 
 
247 aa  59.7  4e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  26.67 
 
 
280 aa  59.7  4e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2261  racemase, putative  26.15 
 
 
238 aa  60.1  4e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113318  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  26.15 
 
 
287 aa  59.3  5e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2139  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.57 
 
 
239 aa  59.3  6e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0396546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3190  hypothetical protein  29.56 
 
 
216 aa  57.8  2e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4026  hydantoin racemase  27.71 
 
 
266 aa  56.2  4e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.997842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5914  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.82 
 
 
241 aa  55.8  5e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5283  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.14 
 
 
241 aa  55.1  1e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5846  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.74 
 
 
249 aa  53.1  3e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  hitchhiker  0.000744144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.15 
 
 
253 aa  53.5  3e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1413  Hydantoin racemase-like protein  23.72 
 
 
262 aa  53.5  3e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  24.14 
 
 
243 aa  51.2  1e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2468  Asp/Glu racemase  30.97 
 
 
250 aa  50.1  4e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2107  putative Hydantoin racemase HyuA  26.67 
 
 
212 aa  49.7  4e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1006  Asp/Glu racemase  31.07 
 
 
246 aa  49.7  4e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719563  hitchhiker  0.00113636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>