178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0965 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0965  formamidase  100 
 
 		 388 aa  788    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  52.6 
 
 		 459 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  49.36 
 
 		 393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  37.14 
 
 		 397 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  36.8 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  37.76 
 
 		 414 aa  196  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  35.01 
 
 		 322 aa  195  9e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  35.28 
 
 		 418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  36.91 
 
 		 410 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  33.61 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  37 
 
 		 420 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  35.53 
 
 		 416 aa  179  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  34.86 
 
 		 415 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  32.71 
 
 		 318 aa  178  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  32.88 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  34.66 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  35.16 
 
 		 409 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  35.53 
 
 		 418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  35.49 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  33.52 
 
 		 314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  34.66 
 
 		 418 aa  172  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  34.64 
 
 		 411 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  31.94 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  34.06 
 
 		 319 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  34.69 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  33.79 
 
 		 319 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  33.79 
 
 		 319 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  34.96 
 
 		 409 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  34.77 
 
 		 417 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  34.77 
 
 		 417 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  34.77 
 
 		 417 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  36.58 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  34.46 
 
 		 410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  34.37 
 
 		 410 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  34.02 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  34.96 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  34.47 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  33.59 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  35.41 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  32.37 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  34.94 
 
 		 408 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  34.01 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  34.01 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  34.01 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  34.45 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  34.45 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  35.79 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  33.83 
 
 		 451 aa  159  8e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  33.16 
 
 		 410 aa  159  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  33.67 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  32.42 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  34.03 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  33.75 
 
 		 409 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  30.39 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  30.11 
 
 		 312 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  31.83 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  34.77 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  29.56 
 
 		 312 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  33.68 
 
 		 409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  33.42 
 
 		 409 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  30.14 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  26.52 
 
 		 328 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  32.54 
 
 		 301 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  27.79 
 
 		 360 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  29.77 
 
 		 305 aa  110  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  26.83 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  26.88 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  29.09 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  29.33 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  27.64 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  28.3 
 
 		 337 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  29.7 
 
 		 315 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  26.36 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  25.48 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  26.09 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  27.03 
 
 		 337 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  27.03 
 
 		 337 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  26.96 
 
 		 366 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  29.37 
 
 		 312 aa  99.8  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  26.89 
 
 		 339 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  28.02 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  26.59 
 
 		 304 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  29.32 
 
 		 321 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  24.24 
 
 		 311 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  25.99 
 
 		 330 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  25.72 
 
 		 304 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  25.72 
 
 		 304 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  29.59 
 
 		 321 aa  96.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  24.5 
 
 		 304 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  26.51 
 
 		 337 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  29.43 
 
 		 316 aa  96.3  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  25.99 
 
 		 359 aa  96.3  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  25.07 
 
 		 304 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  25.75 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  26.9 
 
 		 350 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  25.43 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  25.87 
 
 		 329 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  28.25 
 
 		 332 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  25.22 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  26.72 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>