More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0964 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 803 aa  1629    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  41.73 
 
 		 755 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  38.43 
 
 		 780 aa  537  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  38.92 
 
 		 790 aa  529  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  38.22 
 
 		 792 aa  499  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  38.78 
 
 		 761 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  37.75 
 
 		 790 aa  495  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  38.49 
 
 		 807 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  39.15 
 
 		 780 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  37.26 
 
 		 765 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  36.58 
 
 		 832 aa  461  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  36.86 
 
 		 776 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 860 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 859 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 867 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  35.04 
 
 		 856 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 851 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 		 796 aa  349  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 761 aa  347  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 704 aa  340  9e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 775 aa  334  4e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 743 aa  331  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 710 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 741 aa  319  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 804 aa  312  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 720 aa  310  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 758 aa  303  9e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 753 aa  302  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 728 aa  301  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 730 aa  301  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 758 aa  297  6e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 786 aa  296  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.95 
 
 		 739 aa  296  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 758 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 730 aa  294  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  29.47 
 
 		 754 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 728 aa  290  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 784 aa  289  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  29.37 
 
 		 751 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 771 aa  287  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 732 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 722 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 784 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 759 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 763 aa  281  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 749 aa  280  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 750 aa  280  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 758 aa  278  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 787 aa  278  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 794 aa  275  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 785 aa  275  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 745 aa  272  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 774 aa  270  8.999999999999999e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 764 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 759 aa  269  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 746 aa  265  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 773 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 782 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 758 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 780 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 764 aa  258  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  30.18 
 
 		 741 aa  257  7e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 792 aa  256  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 743 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 779 aa  256  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 777 aa  255  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 737 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 723 aa  254  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 734 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 779 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 730 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 771 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 751 aa  248  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 729 aa  248  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 756 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 733 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 743 aa  243  7e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 713 aa  243  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 732 aa  241  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 769 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 755 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 809 aa  240  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 763 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 777 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  28.48 
 
 		 748 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 825 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 747 aa  234  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 808 aa  233  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 722 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 755 aa  230  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 817 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.44 
 
 		 715 aa  229  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 774 aa  229  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 771 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 775 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  26.81 
 
 		 763 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 777 aa  225  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 773 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 764 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 772 aa  221  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>