More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0956 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  100 
 
 
150 aa  311  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  85.81 
 
 
149 aa  275  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  82.67 
 
 
150 aa  268  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  80.54 
 
 
149 aa  265  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  81.08 
 
 
149 aa  261  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  77.7 
 
 
150 aa  248  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  76 
 
 
150 aa  248  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  57.33 
 
 
150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  54.67 
 
 
150 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  55.33 
 
 
150 aa  179  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  54.67 
 
 
150 aa  177  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  54.67 
 
 
153 aa  175  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2683  dehydratase  56.67 
 
 
154 aa  174  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  55.33 
 
 
153 aa  174  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  52.7 
 
 
150 aa  173  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1254  MaoC-like protein dehydratase  60.14 
 
 
161 aa  169  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.373696  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  53.79 
 
 
150 aa  164  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2315  dehydratase  53.33 
 
 
169 aa  164  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0892641  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0292  MaoC domain protein dehydratase  53.74 
 
 
166 aa  161  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  52.67 
 
 
150 aa  160  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  48 
 
 
159 aa  152  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3912  dehydratase  51.35 
 
 
169 aa  150  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.675333  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12521  oxidase regulatory-like protein  50.34 
 
 
185 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  48.67 
 
 
152 aa  145  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1312  hypothetical protein  48.28 
 
 
170 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4088  dehydratase  48.98 
 
 
164 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0156653  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  47.3 
 
 
152 aa  142  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  47.62 
 
 
161 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  47.62 
 
 
161 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  47.62 
 
 
161 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2555  dehydratase  47.62 
 
 
164 aa  141  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  48.05 
 
 
155 aa  140  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1360  MaoC domain protein dehydratase  48.65 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0206053  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2924  MaoC-like dehydratase  50 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06880  acyl dehydratase  48.25 
 
 
176 aa  135  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2716  MaoC-like dehydratase  47.26 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695357  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  46.85 
 
 
166 aa  133  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00460  acyl dehydratase  46.53 
 
 
165 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  46.15 
 
 
166 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  42.76 
 
 
156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  41.89 
 
 
169 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3318  MaoC domain protein dehydratase  47.62 
 
 
175 aa  130  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4170  MaoC-like dehydratase  44.83 
 
 
172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4180  MaoC-like dehydratase  44.83 
 
 
172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0213114  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2103  MaoC domain protein dehydratase  43.84 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4064  dehydratase  45.95 
 
 
173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3849  MaoC domain protein dehydratase  46.15 
 
 
168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0670  MaoC-like dehydratase  41.78 
 
 
168 aa  123  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00727845  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2737  MaoC-like dehydratase  41.78 
 
 
168 aa  123  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1390  dehydratase  45.27 
 
 
186 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.542578  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  43.54 
 
 
199 aa  121  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2304  Acyl dehydratase  40.54 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.69727  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0609  MaoC domain-containing protein  40.54 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442461  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1652  MoaC domain-containing protein  40.54 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  40.54 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  40.54 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2221  Acyl dehydratase  40.54 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1726  MoaC domain-containing protein  40.54 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1408  MaoC domain protein dehydratase  43.24 
 
 
175 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147029 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  40.82 
 
 
344 aa  116  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6336  MaoC-like dehydratase  41.22 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00693601  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2533  dehydratase  41.5 
 
 
175 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164666  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4212  MaoC domain protein dehydratase  40.14 
 
 
174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3361  hypothetical protein  44.27 
 
 
175 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.864271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3368  hypothetical protein  44.27 
 
 
175 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.487735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3463  hypothetical protein  44.27 
 
 
175 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2117  MaoC domain-containing protein  41.22 
 
 
175 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.456393 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2157  MaoC domain-containing protein  41.22 
 
 
175 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2267  dehydratase  41.22 
 
 
216 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1721  dehydratase  41.96 
 
 
184 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775583  normal  0.261141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0676  dehydratase  39.46 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251329  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3294  FkbR2  44.27 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.754163 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0832  putative dehydratase  40.41 
 
 
161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0146859 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1709  dehydrogenase with MaoC-like domain  41.1 
 
 
174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2919  dehydratase  40.54 
 
 
184 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0480  MaoC domain-containing protein  40.41 
 
 
174 aa  107  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4032  dehydratase  38.51 
 
 
190 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962919  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4501  dehydratase  37.84 
 
 
169 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2168  MaoC-like dehydratase  38.51 
 
 
169 aa  106  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.234418  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0731  dehydratase  38.1 
 
 
171 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7764  MaoC domain protein dehydratase  37.16 
 
 
167 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4264  MaoC domain protein dehydratase  37.16 
 
 
169 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0555425  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1582  dehydratase  41.22 
 
 
162 aa  100  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0997283  hitchhiker  0.00301397 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1603  MaoC domain protein dehydratase  39.6 
 
 
172 aa  99  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.535625  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1459  dehydratase  35.14 
 
 
177 aa  97.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0462  dehydratase  37.24 
 
 
163 aa  97.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.244814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3023  dehydratase  34.27 
 
 
171 aa  96.7  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  33.12 
 
 
161 aa  96.3  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  38.93 
 
 
166 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7163  MaoC-like dehydratase  36.43 
 
 
167 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  36.99 
 
 
148 aa  93.6  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2195  MaoC domain protein dehydratase  37.24 
 
 
161 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.300893 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1872  MaoC domain protein dehydratase  37.24 
 
 
161 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4127  dehydratase  36.81 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0566  dehydratase  35.86 
 
 
344 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.090067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2549  dehydratase  32.88 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0407782  normal  0.257026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  37.4 
 
 
160 aa  87.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0316  dehydratase  34.48 
 
 
148 aa  87.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2043  hypothetical protein  31.97 
 
 
156 aa  87  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.770796  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0495  dehydratase  34.01 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>