159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0938 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  100 
 
 		 611 aa  1255    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  34.11 
 
 		 594 aa  250  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  34.35 
 
 		 571 aa  244  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.32 
 
 		 595 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  29.85 
 
 		 547 aa  233  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  31.02 
 
 		 588 aa  227  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.93 
 
 		 550 aa  219  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.25 
 
 		 587 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.94 
 
 		 577 aa  200  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  33.78 
 
 		 576 aa  200  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  28.69 
 
 		 595 aa  196  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.25 
 
 		 647 aa  193  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28.26 
 
 		 625 aa  183  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  28.07 
 
 		 557 aa  173  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  25.58 
 
 		 542 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.19 
 
 		 561 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  27.98 
 
 		 653 aa  167  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.02 
 
 		 580 aa  166  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3231  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28 
 
 		 534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.27 
 
 		 545 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  27.59 
 
 		 553 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28.22 
 
 		 529 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.45 
 
 		 568 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3451  peptidase S15  28.16 
 
 		 637 aa  151  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3450  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.65 
 
 		 643 aa  150  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.19 
 
 		 550 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  25.04 
 
 		 541 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  24.76 
 
 		 641 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  29.66 
 
 		 549 aa  147  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  25.04 
 
 		 541 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4699  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.72 
 
 		 542 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8686  peptidase S15  26.04 
 
 		 529 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  25.82 
 
 		 540 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.99 
 
 		 546 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3228  peptidase S15  27.15 
 
 		 627 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.46374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.26 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3107  peptidase S15  26.91 
 
 		 641 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0343  glutaryl-7-ACA acylase precursor  26.07 
 
 		 660 aa  136  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00753978  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0309  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.86 
 
 		 663 aa  136  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00338  alpha-amino acid ester hydrolase  26.89 
 
 		 637 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.015152  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  25.6 
 
 		 667 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  26.45 
 
 		 628 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2091  peptidase S15  25.26 
 
 		 551 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406415  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  25.32 
 
 		 670 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2137  peptidase S15  25.26 
 
 		 551 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2074  peptidase S15  25.26 
 
 		 551 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1612  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1582  peptidase S15  24.83 
 
 		 617 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0600255 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3209  peptidase S15  25.63 
 
 		 670 aa  134  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0955125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  24.58 
 
 		 677 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  25.51 
 
 		 680 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  28.68 
 
 		 537 aa  133  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  25.93 
 
 		 679 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  27.17 
 
 		 714 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.06 
 
 		 570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  26.14 
 
 		 650 aa  131  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  24.01 
 
 		 638 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  26.56 
 
 		 673 aa  130  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.04 
 
 		 629 aa  130  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  26.78 
 
 		 615 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  25.37 
 
 		 677 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  24.64 
 
 		 625 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  25.32 
 
 		 670 aa  128  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2367  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.41 
 
 		 645 aa  128  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  25.97 
 
 		 668 aa  127  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  25.49 
 
 		 668 aa  126  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.29 
 
 		 605 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  27.23 
 
 		 612 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4602  peptidase S15  22.76 
 
 		 582 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.712555  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0314  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.41 
 
 		 666 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.820883 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  26.33 
 
 		 558 aa  124  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0574  peptidase S15  27.57 
 
 		 556 aa  124  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  26.09 
 
 		 665 aa  124  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  25.18 
 
 		 667 aa  124  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2464  peptidase S15  25.54 
 
 		 700 aa  123  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.767373  normal  0.647633 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1942  putative acyl esterase  26.03 
 
 		 558 aa  123  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395341  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  26.02 
 
 		 668 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  25.37 
 
 		 677 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2030  peptidase S15  27.35 
 
 		 547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.743572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  24.31 
 
 		 667 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  24.03 
 
 		 668 aa  120  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  23.16 
 
 		 630 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  25.12 
 
 		 673 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2322  peptidase S15  26.57 
 
 		 545 aa  117  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  0.0430991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1711  peptidase S15  26.6 
 
 		 548 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.483969  normal  0.79803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  25.74 
 
 		 534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  25.36 
 
 		 667 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  25.36 
 
 		 667 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1103  peptidase S15  27.29 
 
 		 550 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734312  normal  0.309388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  25.91 
 
 		 674 aa  112  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  24.79 
 
 		 644 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.21 
 
 		 645 aa  111  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  25.96 
 
 		 674 aa  110  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.56 
 
 		 585 aa  110  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08881  Alpha-amino acid ester hydrolase  23.22 
 
 		 618 aa  110  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2821  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  29.53 
 
 		 626 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2865  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.53 
 
 		 626 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  24.32 
 
 		 690 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4032  peptidase S15  25.99 
 
 		 544 aa  103  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  28 
 
 		 499 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3343  putative acylase  22.61 
 
 		 636 aa  101  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.843899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>