194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0930 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  49.26 
 
 		 677 aa  661    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  100 
 
 		 714 aa  1450    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  47.19 
 
 		 677 aa  610  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  46.31 
 
 		 678 aa  600  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  47.2 
 
 		 677 aa  595  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  44.9 
 
 		 679 aa  579  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  44.94 
 
 		 667 aa  567  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  43.2 
 
 		 670 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  45.78 
 
 		 677 aa  560  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  43.76 
 
 		 704 aa  558  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  43.54 
 
 		 673 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  42.45 
 
 		 670 aa  552  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  43.83 
 
 		 680 aa  551  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  44 
 
 		 668 aa  551  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  43.58 
 
 		 674 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  42.67 
 
 		 690 aa  538  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  39.94 
 
 		 663 aa  519  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  40.6 
 
 		 690 aa  484  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  40.03 
 
 		 674 aa  478  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  40.89 
 
 		 668 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  36.35 
 
 		 670 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  36.9 
 
 		 670 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  39.76 
 
 		 667 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  39.91 
 
 		 667 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  35.86 
 
 		 667 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  37.94 
 
 		 665 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  36.01 
 
 		 667 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  36.83 
 
 		 650 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28231  predicted protein  33.43 
 
 		 711 aa  366  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0269  peptidase S15  40.49 
 
 		 745 aa  353  5e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485084  normal  0.582003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  31.59 
 
 		 705 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.55 
 
 		 594 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  27.61 
 
 		 644 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  27.3 
 
 		 612 aa  150  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.78 
 
 		 595 aa  138  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  26.47 
 
 		 571 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  27.19 
 
 		 555 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.51 
 
 		 550 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.17 
 
 		 611 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  26.8 
 
 		 534 aa  132  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  27.71 
 
 		 615 aa  132  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.76 
 
 		 625 aa  132  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  25.04 
 
 		 668 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  23.85 
 
 		 547 aa  128  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25 
 
 		 588 aa  127  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  25.05 
 
 		 542 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  24.15 
 
 		 668 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  25.66 
 
 		 553 aa  125  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.81 
 
 		 678 aa  124  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.48 
 
 		 647 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  28.42 
 
 		 576 aa  120  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  25.8 
 
 		 595 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  25.81 
 
 		 655 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  23.46 
 
 		 686 aa  115  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  23.95 
 
 		 540 aa  114  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.81 
 
 		 568 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  24.81 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  24.62 
 
 		 541 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.09 
 
 		 585 aa  109  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  27.09 
 
 		 557 aa  109  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.05 
 
 		 576 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  25.96 
 
 		 679 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.41 
 
 		 545 aa  103  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  26.71 
 
 		 549 aa  103  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3343  putative acylase  22.89 
 
 		 636 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.843899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.15 
 
 		 529 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  24.1 
 
 		 569 aa  99.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6822  peptidase S15  27.35 
 
 		 503 aa  95.5  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4534  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.62 
 
 		 609 aa  95.1  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  23.77 
 
 		 653 aa  94.7  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  32.87 
 
 		 499 aa  94.7  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5443  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.48 
 
 		 625 aa  93.6  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.79 
 
 		 570 aa  92.8  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5053  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.83 
 
 		 561 aa  93.2  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842061  normal  0.996249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  22.5 
 
 		 641 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.185507 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07789  conserved hypothetical protein  24.23 
 
 		 588 aa  91.7  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183202  normal  0.814624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3305  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.3 
 
 		 611 aa  91.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.0581087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4602  peptidase S15  22.53 
 
 		 582 aa  90.9  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.712555  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.67 
 
 		 561 aa  90.5  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1460  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  25.35 
 
 		 607 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  25.39 
 
 		 673 aa  89  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.65 
 
 		 605 aa  87.4  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  27.84 
 
 		 598 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  22.29 
 
 		 630 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.81 
 
 		 577 aa  84.3  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1942  putative acyl esterase  26.19 
 
 		 558 aa  84.3  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395341  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1582  peptidase S15  22.05 
 
 		 617 aa  84  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0600255 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08881  Alpha-amino acid ester hydrolase  20.35 
 
 		 618 aa  83.2  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.18 
 
 		 546 aa  83.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  25.48 
 
 		 558 aa  83.2  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  21.92 
 
 		 638 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1938  hydrolase CocE/NonD family protein  23.35 
 
 		 644 aa  82.8  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.91 
 
 		 587 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27540  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  25.45 
 
 		 584 aa  82  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0921  acyl esterase  25.48 
 
 		 531 aa  82.4  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4032  peptidase S15  25.43 
 
 		 544 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  20.88 
 
 		 625 aa  80.9  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2667  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  21.58 
 
 		 597 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.300273  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.35 
 
 		 599 aa  80.5  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2664  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  21.94 
 
 		 574 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>