216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0917 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 		 386 aa  781    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  41.84 
 
 		 368 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  40.63 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  33.82 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  33.43 
 
 		 323 aa  176  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  32.56 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  31.98 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  31.1 
 
 		 324 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  29.45 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  29.13 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  30.54 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  30.92 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  29.79 
 
 		 323 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  30.81 
 
 		 323 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  30.81 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  30.81 
 
 		 323 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  30.81 
 
 		 323 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  30.81 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  30.23 
 
 		 323 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  29.82 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  30.12 
 
 		 323 aa  156  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  30.52 
 
 		 323 aa  155  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  29.76 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  28.57 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  30.06 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  29.35 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  28.87 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  29.17 
 
 		 329 aa  153  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  29.31 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  28.95 
 
 		 323 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  28.95 
 
 		 323 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  28.95 
 
 		 323 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  28.95 
 
 		 323 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  28.95 
 
 		 323 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  28.95 
 
 		 323 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  28.95 
 
 		 323 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  29.41 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  30.95 
 
 		 357 aa  143  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  30.35 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  29.19 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  28.61 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  28.61 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  27.69 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  28.32 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  28.32 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  28.32 
 
 		 325 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  28.61 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  27.75 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  28.7 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  26.67 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  33.33 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  26.79 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  25.93 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  27.17 
 
 		 325 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  32.12 
 
 		 400 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  27.79 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  29.91 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  29.41 
 
 		 379 aa  130  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  26.88 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  28.72 
 
 		 388 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  28.44 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  31.15 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  30.25 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  26.55 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  28.04 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  27.49 
 
 		 388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  26.29 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  28.9 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  27.25 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  27.15 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  30.8 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0845  peptidase M19 renal dipeptidase  27.43 
 
 		 390 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.773406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0751  twin-arginine translocation pathway signal  27.03 
 
 		 391 aa  116  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  25.88 
 
 		 396 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3756  peptidase M19, renal dipeptidase  29.14 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3183  twin-arginine translocation pathway signal  27.87 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  33.2 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  30.12 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.8 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  29.5 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  26.46 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  29.66 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  32.24 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  26.92 
 
 		 311 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  28.24 
 
 		 313 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0806  peptidase M19, renal dipeptidase  26.46 
 
 		 387 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  29.51 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  27.76 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  26.21 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  27.87 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  32.21 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  27.99 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  29.85 
 
 		 326 aa  100  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  28.03 
 
 		 418 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  28.1 
 
 		 355 aa  99.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  26 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  26.3 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  25 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  34.13 
 
 		 223 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  29.57 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>