More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0899 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 764 aa  1559    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  38.54 
 
 		 782 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 772 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 779 aa  361  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 730 aa  359  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 743 aa  345  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  34.54 
 
 		 773 aa  335  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  33.64 
 
 		 733 aa  333  6e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 774 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  31.04 
 
 		 789 aa  296  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 767 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 763 aa  284  4.0000000000000003e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 789 aa  274  5.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 765 aa  259  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 720 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 743 aa  243  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 755 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 732 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  32.66 
 
 		 739 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 761 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 759 aa  238  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 790 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 803 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 722 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 771 aa  231  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 775 aa  230  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 743 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 704 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 755 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 737 aa  226  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 761 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 746 aa  224  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 726 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 783 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 809 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 780 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 787 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 710 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 753 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 722 aa  210  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 822 aa  210  9e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 790 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 794 aa  208  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 747 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 790 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 749 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 767 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 700 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 795 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 741 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 776 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 756 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 780 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 733 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 796 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 856 aa  198  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 730 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 758 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 853 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 860 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 796 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 851 aa  196  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 736 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 730 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 761 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 713 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 792 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 758 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 777 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 763 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 744 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 773 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 695 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 748 aa  191  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 771 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 713 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 780 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 794 aa  189  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 717 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 777 aa  187  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 773 aa  187  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 766 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 785 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 809 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 784 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 764 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 764 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 808 aa  184  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 788 aa  183  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  28.64 
 
 		 776 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 859 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 726 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 807 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 751 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 784 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 867 aa  181  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 810 aa  181  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 806 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 767 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 763 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>