245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0849 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0849  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1143  hypothetical protein  68.83 
 
 
247 aa  337  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0813  hypothetical protein  72.73 
 
 
242 aa  323  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0875239  hitchhiker  0.00101032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1395  hypothetical protein  56.08 
 
 
252 aa  275  7e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.681625  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0088  hypothetical protein  55.06 
 
 
245 aa  256  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  53.85 
 
 
245 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0086  hypothetical protein  55.06 
 
 
245 aa  255  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0100  hypothetical protein  52.29 
 
 
260 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  57.33 
 
 
242 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3353  hypothetical protein  51.79 
 
 
248 aa  247  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  53.28 
 
 
256 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4057  protein of unknown function UPF0005  54.67 
 
 
242 aa  242  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  51.42 
 
 
256 aa  242  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2225  protein of unknown function UPF0005  53.2 
 
 
255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0352825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4482  protein of unknown function UPF0005  54.94 
 
 
236 aa  238  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6220  hypothetical protein  51.68 
 
 
238 aa  238  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1019  hypothetical protein  50.97 
 
 
256 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.219255  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4550  hypothetical protein  53.81 
 
 
236 aa  238  8e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1889  hypothetical protein  58.65 
 
 
246 aa  234  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0536  hypothetical protein  58.65 
 
 
246 aa  234  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6013  protein of unknown function UPF0005  52.14 
 
 
236 aa  234  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2043  hypothetical protein  49.24 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28558  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2543  protein of unknown function UPF0005  50.78 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.0807809 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0671  hypothetical protein  57.08 
 
 
246 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  decreased coverage  0.00362929 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7161  protein of unknown function UPF0005  50.62 
 
 
236 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147509  normal  0.897358 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3093  integral membrane protein  52.32 
 
 
237 aa  225  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.718082  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  50.78 
 
 
256 aa  225  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3820  hypothetical protein  52.32 
 
 
237 aa  225  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0413  hypothetical protein  50.78 
 
 
263 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229598  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  53.42 
 
 
239 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0001  hypothetical protein  49.17 
 
 
257 aa  223  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2779  hypothetical protein  51.09 
 
 
240 aa  221  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196634  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0287  hypothetical protein  49.61 
 
 
263 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0137467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0260  protein of unknown function UPF0005  49.22 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0529527  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3673  hypothetical protein  52.12 
 
 
236 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.915645 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1913  hypothetical protein  50.4 
 
 
259 aa  219  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.841584  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1912  protein of unknown function UPF0005  48.57 
 
 
261 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0386  putative transport protein  49.03 
 
 
263 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0200  hypothetical protein  48.3 
 
 
271 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0529  hypothetical protein  48.45 
 
 
263 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1779  protein of unknown function UPF0005  49.18 
 
 
274 aa  214  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5468  hypothetical protein  48.06 
 
 
274 aa  214  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0129  hypothetical protein  55.66 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.576127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3558  hypothetical protein  48.95 
 
 
250 aa  211  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0050  putative membrane proetin  46.67 
 
 
251 aa  211  7.999999999999999e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0551  hypothetical protein  47.78 
 
 
271 aa  209  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2268  hypothetical protein  53.62 
 
 
294 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.476385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0828  hypothetical protein  46.22 
 
 
256 aa  202  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5385  hypothetical protein  47.19 
 
 
241 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3668  hypothetical protein  41.77 
 
 
244 aa  194  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16725  hitchhiker  0.0000130091 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0937  hypothetical protein  42.45 
 
 
234 aa  194  1e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419647  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0009  hypothetical protein  45.29 
 
 
233 aa  194  1e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.0000179437  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00753  predicted inner membrane protein  48.18 
 
 
234 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2856  protein of unknown function UPF0005  48.18 
 
 
234 aa  182  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2857  hypothetical protein  48.18 
 
 
234 aa  182  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496163 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0849  hypothetical protein  48.18 
 
 
234 aa  182  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2566  hypothetical protein  48.18 
 
 
234 aa  182  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0840  hypothetical protein  48.18 
 
 
234 aa  182  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00770  hypothetical protein  48.18 
 
 
234 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0809  hypothetical protein  48.4 
 
 
234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00257878  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2918  hypothetical protein  44.21 
 
 
236 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.117943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2832  hypothetical protein  44.21 
 
 
236 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0934  hypothetical protein  47.73 
 
 
234 aa  180  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1438  hypothetical protein  43.8 
 
 
236 aa  179  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1325  hypothetical protein  44.58 
 
 
236 aa  178  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2081  protein of unknown function UPF0005  47.17 
 
 
224 aa  175  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0430200000000002e-29 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  43.04 
 
 
235 aa  174  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2518  protein of unknown function UPF0005  44.44 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0945287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2135  protein of unknown function UPF0005  47.17 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4993  hypothetical protein  47.23 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1278  hypothetical protein  43.15 
 
 
235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278652  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0842  inner membrane protein YbhL  46.15 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0956  inner membrane protein YbhL  46.15 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0901  inner membrane protein YbhL  46.15 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0870  membrane protein  46.15 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484875  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0950  hypothetical protein  44.02 
 
 
240 aa  169  3e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.816971  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1437  protein of unknown function UPF0005  46.19 
 
 
219 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2947  protein of unknown function UPF0005  43.72 
 
 
235 aa  168  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0933  hypothetical protein  45.7 
 
 
237 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  47.64 
 
 
228 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1517  hypothetical protein  42.61 
 
 
235 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1173  protein of unknown function UPF0005  44.29 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00047203  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  44.04 
 
 
236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0912  hypothetical protein  43.93 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409421  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0795  hypothetical protein  41.78 
 
 
236 aa  157  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0927  protein of unknown function UPF0005  41.84 
 
 
235 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.441127 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  39.91 
 
 
235 aa  155  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1228  hypothetical protein  43.21 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.181817  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  37.5 
 
 
232 aa  149  3e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4095  protein of unknown function UPF0005  42.79 
 
 
236 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2972  hypothetical protein  43.12 
 
 
237 aa  148  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416031  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3983  hypothetical protein  42.79 
 
 
236 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4126  protein of unknown function UPF0005  42.33 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0772  hypothetical protein  40.09 
 
 
233 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.768217  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0302  hypothetical protein  40.38 
 
 
234 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171893  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3162  protein of unknown function UPF0005  41.12 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  37.04 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2141  hypothetical protein  40.64 
 
 
232 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000126118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  37.16 
 
 
233 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3782  protein of unknown function UPF0005  41.62 
 
 
249 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>