30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0794 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0794  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 539 aa  1067    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2638  hypothetical protein  42.58 
 
 		 681 aa  355  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.55896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1674  hypothetical protein  42.2 
 
 		 754 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2424  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.04 
 
 		 986 aa  111  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.918325  normal  0.204979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  24.86 
 
 		 1131 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  24.47 
 
 		 1102 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08530  TIR-like domain-containing protein (DUF1863)  38.42 
 
 		 875 aa  101  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  24.93 
 
 		 1124 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0160  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 897 aa  98.6  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  24.48 
 
 		 1089 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  24.48 
 
 		 1089 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  24.02 
 
 		 1063 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  23.74 
 
 		 1080 aa  93.6  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  22.99 
 
 		 1075 aa  92.8  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  23.44 
 
 		 1067 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  23.75 
 
 		 1092 aa  89  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  24.22 
 
 		 1075 aa  88.6  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  27.33 
 
 		 1074 aa  87.4  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  23.37 
 
 		 1075 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  28.87 
 
 		 1087 aa  77  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  24.76 
 
 		 1092 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 		 1082 aa  60.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4246  WD-40 repeat-containing protein  38.38 
 
 		 958 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  25.9 
 
 		 1611 aa  53.9  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1123 aa  53.5  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  21.78 
 
 		 732 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4338  hypothetical protein  26.15 
 
 		 711 aa  51.2  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.28 
 
 		 919 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5674  WD-40 repeat protein  29.46 
 
 		 973 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  27.56 
 
 		 303 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>