More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0725 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 790 aa  1603    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  67.13 
 
 		 792 aa  1079    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  58.2 
 
 		 790 aa  910    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  39.76 
 
 		 755 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  38.8 
 
 		 803 aa  525  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  38.35 
 
 		 832 aa  474  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  37.78 
 
 		 807 aa  452  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  37.05 
 
 		 780 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  35.55 
 
 		 761 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  35.6 
 
 		 780 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  35.76 
 
 		 765 aa  405  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  35.84 
 
 		 761 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  34.45 
 
 		 776 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 867 aa  381  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 860 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 851 aa  379  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 859 aa  368  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 704 aa  344  4e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 783 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 720 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 710 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 786 aa  307  6e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 753 aa  306  9.000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 856 aa  305  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 728 aa  302  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 794 aa  300  6e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 743 aa  300  9e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 741 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 758 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 784 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 775 aa  292  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 730 aa  287  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 734 aa  287  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 796 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 743 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 804 aa  281  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 732 aa  280  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 730 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 771 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 729 aa  279  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 787 aa  278  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 763 aa  277  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  31.84 
 
 		 759 aa  274  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 745 aa  274  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 758 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 758 aa  272  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 749 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 771 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 758 aa  271  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 780 aa  271  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 758 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 785 aa  263  8e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 728 aa  263  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 747 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 759 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 723 aa  259  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 730 aa  257  6e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.76 
 
 		 739 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 751 aa  255  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 764 aa  254  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 808 aa  253  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 817 aa  253  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 726 aa  253  9.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 779 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 770 aa  248  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 779 aa  247  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 733 aa  247  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  28.61 
 
 		 741 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 774 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 750 aa  244  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 771 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 773 aa  244  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 790 aa  244  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 771 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 737 aa  241  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 771 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 773 aa  241  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 755 aa  240  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 790 aa  240  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.31 
 
 		 754 aa  240  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 784 aa  238  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 767 aa  237  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 700 aa  237  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 766 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 730 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 724 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 762 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 773 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 769 aa  231  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 775 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 782 aa  230  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 755 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 794 aa  229  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  30.54 
 
 		 807 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 769 aa  227  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 753 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 713 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 764 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 761 aa  225  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 796 aa  225  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>