279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0717 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  48.53 
 
 		 875 aa  678    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  52.22 
 
 		 841 aa  737    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  48.33 
 
 		 838 aa  664    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  47.53 
 
 		 871 aa  688    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  53.93 
 
 		 826 aa  758    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  49.81 
 
 		 863 aa  709    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  51.93 
 
 		 872 aa  723    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  50.63 
 
 		 899 aa  689    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  56.27 
 
 		 820 aa  869    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  49.29 
 
 		 859 aa  706    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  57.34 
 
 		 792 aa  800    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  48.08 
 
 		 857 aa  699    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  59.37 
 
 		 800 aa  906    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  49.81 
 
 		 856 aa  708    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  49.22 
 
 		 836 aa  702    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  52.48 
 
 		 884 aa  700    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  53.28 
 
 		 757 aa  699    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  49.09 
 
 		 842 aa  713    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  50.74 
 
 		 852 aa  737    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  49.42 
 
 		 859 aa  700    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  48.6 
 
 		 841 aa  699    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  49.29 
 
 		 859 aa  706    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  49.16 
 
 		 859 aa  696    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  49.68 
 
 		 859 aa  706    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  100 
 
 		 779 aa  1561    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  49.29 
 
 		 859 aa  707    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  45.31 
 
 		 811 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.95 
 
 		 741 aa  458  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.24 
 
 		 737 aa  442  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.16 
 
 		 737 aa  437  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  55.7 
 
 		 860 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  60.12 
 
 		 416 aa  399  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  57.54 
 
 		 867 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  60.36 
 
 		 881 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  60.24 
 
 		 430 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  50.25 
 
 		 435 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  45.94 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  49.73 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  49.7 
 
 		 392 aa  363  7.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  60.53 
 
 		 944 aa  362  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  51.54 
 
 		 380 aa  346  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  42.7 
 
 		 419 aa  320  6e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  51.43 
 
 		 386 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  52.32 
 
 		 419 aa  311  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  43.7 
 
 		 370 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  40.96 
 
 		 362 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  42.25 
 
 		 359 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  43.5 
 
 		 366 aa  303  9e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  41.36 
 
 		 359 aa  302  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  45.51 
 
 		 367 aa  298  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  43.79 
 
 		 359 aa  298  2e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  43.77 
 
 		 362 aa  297  5e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  45.4 
 
 		 365 aa  297  6e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  43.62 
 
 		 391 aa  296  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  45.18 
 
 		 376 aa  296  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  46.2 
 
 		 453 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  41.85 
 
 		 352 aa  291  3e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  44.32 
 
 		 356 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  43.34 
 
 		 358 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  39.71 
 
 		 390 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  41.26 
 
 		 384 aa  287  5.999999999999999e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  41.05 
 
 		 352 aa  286  7e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  42.38 
 
 		 380 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  41.64 
 
 		 352 aa  284  5.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  43.37 
 
 		 361 aa  282  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  41.82 
 
 		 351 aa  280  6e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  41.87 
 
 		 381 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  44.44 
 
 		 386 aa  275  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  39.62 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  39.89 
 
 		 384 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  42.25 
 
 		 362 aa  271  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  41.39 
 
 		 364 aa  270  8.999999999999999e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  39.39 
 
 		 356 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  47.08 
 
 		 565 aa  265  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.47 
 
 		 382 aa  265  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  40.06 
 
 		 360 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 361 aa  263  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  46.06 
 
 		 329 aa  262  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  37.29 
 
 		 358 aa  261  3e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  38.98 
 
 		 376 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  39.23 
 
 		 360 aa  259  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  40.7 
 
 		 398 aa  256  8e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  40.95 
 
 		 362 aa  256  9e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  41.18 
 
 		 330 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  42.43 
 
 		 325 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  39.78 
 
 		 368 aa  252  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  39.23 
 
 		 358 aa  251  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  38.67 
 
 		 358 aa  250  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  43.77 
 
 		 387 aa  248  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  47.15 
 
 		 368 aa  247  6e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  41.11 
 
 		 362 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  37.36 
 
 		 361 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  35.96 
 
 		 358 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  43.54 
 
 		 327 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  39.34 
 
 		 358 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  40.11 
 
 		 355 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  36.41 
 
 		 358 aa  244  6e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  43.44 
 
 		 331 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  42.6 
 
 		 321 aa  241  5e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  38.67 
 
 		 359 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>