47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0675 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  32.21 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  35.88 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  36.84 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  31.64 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  37.5 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  34.97 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  37.98 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  37.98 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  32.32 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  37.98 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  27.21 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  36.8 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  36.43 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  30.56 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  35.43 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  35.04 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  37.31 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  31.98 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  29.1 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  37.21 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  32.95 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2450  PEP2-like protein  29.93 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865841  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  30.77 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  29.2 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  26.95 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  31.09 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3513  hypothetical protein  28.47 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  25.69 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  29.5 
 
 		 450 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  31.5 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  32.26 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  32 
 
 		 358 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  30.4 
 
 		 135 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  30.4 
 
 		 135 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  33.82 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  30 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  29.6 
 
 		 135 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  31.71 
 
 		 141 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  30.28 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  30.46 
 
 		 162 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  28.46 
 
 		 133 aa  41.6  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  29.61 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4230  PEP2 protein-like  25.32 
 
 		 201 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  27.34 
 
 		 138 aa  41.2  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>