More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0673 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 761 aa  1529    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  37.47 
 
 		 765 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  35.42 
 
 		 792 aa  395  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  35.84 
 
 		 790 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 755 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 780 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 807 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 761 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 704 aa  356  1e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 790 aa  347  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  33.42 
 
 		 730 aa  346  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 803 aa  342  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  33.6 
 
 		 743 aa  337  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 776 aa  330  6e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 741 aa  326  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 710 aa  323  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 728 aa  321  3.9999999999999996e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 787 aa  319  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 745 aa  317  7e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 753 aa  313  5.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 758 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 780 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 775 aa  308  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 758 aa  308  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 758 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 732 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 758 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 763 aa  301  3e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 786 aa  301  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 779 aa  301  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 832 aa  299  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 783 aa  298  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 856 aa  298  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 796 aa  297  6e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 759 aa  296  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 730 aa  293  8e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 747 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 728 aa  293  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 736 aa  291  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 720 aa  290  7e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 750 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 792 aa  286  9e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 794 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 804 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 737 aa  282  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 774 aa  282  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 749 aa  280  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 764 aa  278  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 730 aa  275  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 743 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 734 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  29.55 
 
 		 754 aa  273  7e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 771 aa  273  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 780 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 777 aa  269  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 743 aa  267  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 771 aa  267  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 779 aa  267  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 758 aa  266  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 785 aa  266  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  29.15 
 
 		 751 aa  265  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 755 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 767 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 771 aa  264  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 771 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 773 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 723 aa  260  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 796 aa  260  7e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 764 aa  259  9e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.83 
 
 		 739 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 794 aa  259  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  30.15 
 
 		 759 aa  258  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 729 aa  257  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 756 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 784 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 695 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 773 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 817 aa  254  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  31.08 
 
 		 733 aa  253  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 766 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 762 aa  251  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 726 aa  250  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 773 aa  251  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  29.32 
 
 		 807 aa  249  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  30.15 
 
 		 797 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 759 aa  244  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  30.25 
 
 		 741 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 782 aa  243  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 733 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 720 aa  243  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 784 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 722 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 731 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 754 aa  238  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 771 aa  237  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 713 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 770 aa  236  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 725 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  28.8 
 
 		 748 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 806 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>