More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0569 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0569  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 397 aa  792    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0258  coproporphyrinogen III oxidase  67.11 
 
 		 381 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  64.53 
 
 		 384 aa  465  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0471  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  56.31 
 
 		 392 aa  411  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  57.04 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  56.53 
 
 		 398 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0024  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  56.7 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2155  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  54.74 
 
 		 389 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3460  coproporphyrinogen III oxidase  53.91 
 
 		 387 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0027  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  58.22 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3639  coproporphyrinogen III oxidase  56.08 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0184  coproporphyrinogen III oxidase  54.35 
 
 		 385 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  53.93 
 
 		 393 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2537  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  57.26 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0003  coproporphyrinogen III oxidase  53.4 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.242877  hitchhiker  0.00414143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2941  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  56.23 
 
 		 391 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0191  coproporphyrinogen III oxidase  55.26 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3398  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  54.43 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2870  coproporphyrinogen III oxidase  54.29 
 
 		 384 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0605644  normal  0.195461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0003  coproporphyrinogen III oxidase  53.66 
 
 		 401 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.045882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0330  coproporphyrinogen III oxidase  54.09 
 
 		 385 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0323  coproporphyrinogen III oxidase  53.39 
 
 		 386 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  54.81 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0149  coproporphyrinogen III oxidase  55.15 
 
 		 386 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  53.68 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0423  coproporphyrinogen III oxidase  53.3 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0397  coproporphyrinogen III oxidase  52.88 
 
 		 385 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  53.95 
 
 		 387 aa  378  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0185  coproporphyrinogen III oxidase  51.26 
 
 		 409 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1337  coproporphyrinogen III oxidase  48.97 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0204  coproporphyrinogen III oxidase  52.23 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0013  coproporphyrinogen III oxidase  53.16 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0176  coproporphyrinogen III oxidase  52.36 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1693  coproporphyrinogen III oxidase  54.5 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616989  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0170  coproporphyrinogen III oxidase  51.4 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.379163  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.12 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2661  coproporphyrinogen III oxidase  50.79 
 
 		 385 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1224  coproporphyrinogen III oxidase  50.13 
 
 		 385 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2885  coproporphyrinogen III oxidase  49.87 
 
 		 385 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3011  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.47 
 
 		 389 aa  300  4e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0173  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.04 
 
 		 387 aa  294  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  42.89 
 
 		 407 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.48 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.79 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0052  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  40.47 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0403831  normal  0.42577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  40.16 
 
 		 413 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  39.9 
 
 		 419 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  39.26 
 
 		 404 aa  252  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  40.48 
 
 		 379 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  36.68 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2472  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.52 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 		 404 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  37.82 
 
 		 409 aa  249  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.88 
 
 		 396 aa  249  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  37.37 
 
 		 404 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  37.37 
 
 		 404 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  37.37 
 
 		 404 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.63 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  38.85 
 
 		 399 aa  246  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.35 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3455  coproporphyrinogen III oxidase  40.16 
 
 		 380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.766268  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  37.12 
 
 		 409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3387  coproporphyrinogen III oxidase  39.74 
 
 		 378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4258  coproporphyrinogen III oxidase  39.47 
 
 		 378 aa  246  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3359  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  37.43 
 
 		 385 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0740  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.47 
 
 		 378 aa  245  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3577  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.1 
 
 		 390 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0892028  normal  0.365381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2703  putative anaerobic coproporphyrinogen III oxidase oxidoreductase protein  38.14 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02785  coproporphyrinogen III oxidase  38.89 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.179359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3115  coproporphyrinogen III oxidase  39.47 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0759  coproporphyrinogen III oxidase  39.47 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573813 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  37.59 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02748  hypothetical protein  38.89 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  37.59 
 
 		 405 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  37.59 
 
 		 405 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  37.59 
 
 		 405 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  37.59 
 
 		 405 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  38.18 
 
 		 422 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  37.34 
 
 		 405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  37.34 
 
 		 405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  39.06 
 
 		 391 aa  243  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1131  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.36 
 
 		 379 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230562  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1258  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 		 385 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0161407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  39.79 
 
 		 391 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1326  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 		 378 aa  242  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02372  coproporphyrinogen III oxidase  39.15 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3361  coproporphyrinogen III oxidase  39.95 
 
 		 380 aa  242  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  37.4 
 
 		 404 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3097  coproporphyrinogen III oxidase  39.01 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  37.4 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1582  coproporphyrinogen III oxidase  36.84 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229924  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1187  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.91 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.454386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0770  coproporphyrinogen III oxidase  38.74 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.261122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0364  coproporphyrinogen III oxidase  39.45 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3299  coproporphyrinogen III oxidase  38.95 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.02 
 
 		 416 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1188  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.65 
 
 		 385 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2161  coproporphyrinogen III oxidase  39.27 
 
 		 424 aa  239  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0050137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0143  coproporphyrinogen III oxidase  38.16 
 
 		 376 aa  239  8e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483536 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0825  coproporphyrinogen III oxidase  38.16 
 
 		 376 aa  239  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.330416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>