More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0517 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 292 aa  600  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  65.41 
 
 		 296 aa  381  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  65.17 
 
 		 291 aa  366  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  57.88 
 
 		 293 aa  342  5.999999999999999e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  58.22 
 
 		 293 aa  340  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  57.93 
 
 		 293 aa  338  5e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  57.44 
 
 		 299 aa  338  5.9999999999999996e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  56.7 
 
 		 295 aa  334  9e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  56.9 
 
 		 290 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  57.53 
 
 		 293 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  60.07 
 
 		 294 aa  328  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  56.55 
 
 		 293 aa  327  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  55.86 
 
 		 300 aa  326  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  54.33 
 
 		 296 aa  326  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  55.52 
 
 		 290 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  55.02 
 
 		 300 aa  325  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  54.33 
 
 		 296 aa  323  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  53.98 
 
 		 296 aa  323  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  58.36 
 
 		 294 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  56.51 
 
 		 291 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  57 
 
 		 294 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  53.45 
 
 		 291 aa  315  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  53.26 
 
 		 291 aa  315  6e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 		 297 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  56.4 
 
 		 299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  55.63 
 
 		 294 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  55.36 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  51.9 
 
 		 298 aa  305  7e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  54.83 
 
 		 299 aa  301  7.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 		 294 aa  301  8.000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  52.74 
 
 		 293 aa  299  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  55.33 
 
 		 291 aa  299  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  54.67 
 
 		 296 aa  295  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  51.21 
 
 		 296 aa  291  9e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  52.6 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  51.21 
 
 		 296 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 		 292 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 296 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 296 aa  271  8.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  47.39 
 
 		 292 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 292 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 292 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 292 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 292 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 292 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  43.92 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  45.7 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  43.4 
 
 		 292 aa  249  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 292 aa  248  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 292 aa  248  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 301 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 292 aa  248  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 292 aa  248  9e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  44.13 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  45.22 
 
 		 291 aa  246  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 		 290 aa  245  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 292 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 292 aa  245  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 292 aa  244  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  44.22 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  46.69 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  46.74 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  44.26 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  44.21 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  44.21 
 
 		 290 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  43.79 
 
 		 290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 292 aa  242  5e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 		 292 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  43.79 
 
 		 302 aa  241  7.999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 292 aa  241  9e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  46.67 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  46.5 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>