More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0432 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  100 
 
 		 623 aa  1243    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  53.39 
 
 		 621 aa  593  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  53.69 
 
 		 625 aa  592  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2316  DNA primase  44.19 
 
 		 633 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102416  normal  0.0205007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2883  DNA primase  43.93 
 
 		 620 aa  432  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.257666  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7521  DNA primase  46.08 
 
 		 629 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1464  DNA primase  45 
 
 		 639 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  47.05 
 
 		 629 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4073  DNA primase  53.13 
 
 		 646 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.302431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  41.57 
 
 		 647 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3298  DNA primase  41.86 
 
 		 665 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.877456 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4263  DNA primase  42.61 
 
 		 641 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0970  DNA primase  51.78 
 
 		 680 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0143224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  44.77 
 
 		 639 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  45.51 
 
 		 627 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0967  DNA primase  41.12 
 
 		 646 aa  401  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0290559  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1480  DNA primase  42.65 
 
 		 655 aa  399  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  50.24 
 
 		 641 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1436  DNA primase  42.65 
 
 		 681 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  50.36 
 
 		 641 aa  395  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2227  DNA primase  45.91 
 
 		 671 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.914663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6776  DNA primase  51.79 
 
 		 671 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  50.49 
 
 		 642 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1686  DNA primase  41.71 
 
 		 656 aa  389  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481097  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2962  DNA primase  41.9 
 
 		 669 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2703  DNA primase  46.92 
 
 		 666 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3973  DNA primase  42.75 
 
 		 685 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1480  DNA primase  39.63 
 
 		 669 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4132  DNA primase  39.75 
 
 		 683 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3106  DNA primase  42.29 
 
 		 678 aa  379  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529982  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2142  DNA primase  38.19 
 
 		 669 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2130  DNA primase  42.12 
 
 		 613 aa  379  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.281855 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0397  DNA primase  44.6 
 
 		 643 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2050  DNA primase  44.4 
 
 		 643 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.279269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0641  DNA primase  50 
 
 		 572 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2441  DNA primase  39.31 
 
 		 634 aa  372  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0792467  normal  0.214631 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0840  DNA primase  48.97 
 
 		 654 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2867  DNA primase  39.1 
 
 		 633 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00143827  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0861  DNA primase  48.92 
 
 		 609 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0925176  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2262  DNA primase  38.39 
 
 		 650 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.9199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3449  DNA primase  37.93 
 
 		 646 aa  357  3.9999999999999996e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3034  DNA primase  42.1 
 
 		 619 aa  353  5.9999999999999994e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.514313  normal  0.0365839 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  42.55 
 
 		 585 aa  348  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  41.5 
 
 		 584 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  39.22 
 
 		 645 aa  346  6e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  45.99 
 
 		 582 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  43.32 
 
 		 584 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  41.06 
 
 		 588 aa  343  8e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  44.7 
 
 		 584 aa  342  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  45.48 
 
 		 582 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  45.48 
 
 		 582 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  45.48 
 
 		 582 aa  341  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  44.96 
 
 		 581 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  44.96 
 
 		 581 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  44.96 
 
 		 581 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  44.96 
 
 		 581 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  44.96 
 
 		 581 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  44.96 
 
 		 581 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  44.96 
 
 		 581 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  43.32 
 
 		 584 aa  340  5e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  44.7 
 
 		 581 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  44.7 
 
 		 581 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  46.09 
 
 		 574 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  45.82 
 
 		 574 aa  337  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  45.74 
 
 		 576 aa  336  5.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  39.15 
 
 		 586 aa  336  5.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  45.82 
 
 		 574 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  45.55 
 
 		 574 aa  334  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  43.54 
 
 		 656 aa  333  5e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  47.79 
 
 		 613 aa  332  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  45.82 
 
 		 574 aa  332  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  38.4 
 
 		 601 aa  332  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  45.55 
 
 		 576 aa  331  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  45.82 
 
 		 574 aa  331  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  44.71 
 
 		 574 aa  330  3e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  45.82 
 
 		 574 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  45.82 
 
 		 574 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  46.63 
 
 		 576 aa  330  6e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  44.7 
 
 		 581 aa  330  6e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  43.67 
 
 		 581 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  43.67 
 
 		 581 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  45.55 
 
 		 574 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  43.67 
 
 		 581 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  43.67 
 
 		 581 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  43.67 
 
 		 581 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  41.23 
 
 		 559 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  41.52 
 
 		 598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  41.55 
 
 		 609 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  41.3 
 
 		 652 aa  327  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  44.74 
 
 		 574 aa  327  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  44.77 
 
 		 573 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  44.77 
 
 		 575 aa  327  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  42.82 
 
 		 586 aa  326  8.000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  44.77 
 
 		 575 aa  323  5e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  44.42 
 
 		 622 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3256  DNA primase  44.42 
 
 		 622 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0530643 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  44.58 
 
 		 594 aa  321  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  44.07 
 
 		 583 aa  321  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  41.52 
 
 		 583 aa  319  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4814  DNA primase  44.2 
 
 		 636 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>