232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0232 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  889    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  51.52 
 
 		 504 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  53.4 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  40.71 
 
 		 503 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  40.52 
 
 		 525 aa  287  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  41.02 
 
 		 512 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  41.02 
 
 		 486 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  41.69 
 
 		 448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  39.49 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  40.44 
 
 		 554 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  42.31 
 
 		 378 aa  269  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  41.13 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  41.45 
 
 		 434 aa  266  8e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  41.34 
 
 		 479 aa  265  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  39.05 
 
 		 494 aa  264  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  38.16 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  35.48 
 
 		 531 aa  259  7e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  42.86 
 
 		 398 aa  259  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  39.22 
 
 		 431 aa  259  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  42.3 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  41.53 
 
 		 474 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  39.84 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  40.33 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  40.35 
 
 		 434 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  36.2 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  39.89 
 
 		 523 aa  249  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  35.25 
 
 		 417 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  35.89 
 
 		 417 aa  248  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  40.06 
 
 		 364 aa  246  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  43.57 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  35.92 
 
 		 443 aa  243  6e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  40.33 
 
 		 366 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  37.77 
 
 		 462 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  40 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  37.76 
 
 		 493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  35.25 
 
 		 442 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  30.72 
 
 		 473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  46.69 
 
 		 374 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  41.86 
 
 		 399 aa  219  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  41.2 
 
 		 387 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  30.28 
 
 		 425 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  41.64 
 
 		 361 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  37.2 
 
 		 467 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  34.75 
 
 		 545 aa  213  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  36.99 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  37.68 
 
 		 390 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  30.86 
 
 		 532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  32.33 
 
 		 428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  29.71 
 
 		 531 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  35.45 
 
 		 419 aa  180  5.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  30 
 
 		 510 aa  179  9e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  29.21 
 
 		 515 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  34.22 
 
 		 491 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  28.72 
 
 		 457 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  32.5 
 
 		 495 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  32.5 
 
 		 495 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  33.83 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  32.22 
 
 		 495 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  28.41 
 
 		 485 aa  174  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  33.71 
 
 		 492 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  34.17 
 
 		 495 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  29.95 
 
 		 420 aa  173  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  28.57 
 
 		 507 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  29.32 
 
 		 498 aa  172  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  32.13 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  35.52 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  33.43 
 
 		 492 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  28.01 
 
 		 518 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  28.7 
 
 		 475 aa  170  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  28.7 
 
 		 475 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  29.82 
 
 		 476 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  29.82 
 
 		 476 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  29.82 
 
 		 476 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  29.82 
 
 		 476 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  28.7 
 
 		 475 aa  170  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  28.7 
 
 		 475 aa  170  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  28.7 
 
 		 475 aa  170  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  28.65 
 
 		 519 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  28.7 
 
 		 475 aa  170  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  28.65 
 
 		 519 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  28.7 
 
 		 475 aa  170  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  28.7 
 
 		 475 aa  170  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  29.82 
 
 		 476 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  28.65 
 
 		 518 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  28.39 
 
 		 448 aa  169  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2124  hypothetical protein  27.47 
 
 		 491 aa  169  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  26.56 
 
 		 522 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1894  hypothetical protein  29.44 
 
 		 520 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  29.58 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  29.56 
 
 		 530 aa  168  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  28.38 
 
 		 519 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  28.38 
 
 		 519 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  29.3 
 
 		 548 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  30.21 
 
 		 424 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  29.82 
 
 		 513 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01951  RmuC  28.4 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  32.28 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_002950  PG0033  RmuC domain-containing protein  27.62 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  28.38 
 
 		 521 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  28.38 
 
 		 521 aa  163  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>