78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0100 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 162 aa  323  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  51.13 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  48.33 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  44.07 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  43.22 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  39.06 
 
 		 295 aa  90.9  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 		 233 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  38.58 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  36 
 
 		 319 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  38.33 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  36 
 
 		 301 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  41.53 
 
 		 151 aa  87.8  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  40.68 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  40.68 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  34.96 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  39.09 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  34.96 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  41.73 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  34.75 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  33.9 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  35.58 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  30.77 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  33.05 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  31.36 
 
 		 335 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  30.22 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  32.79 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  40.45 
 
 		 334 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  40 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  30.77 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  30.77 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  35.38 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  36.27 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  32.06 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  32.06 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  32.06 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  28.46 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  28.46 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  28.46 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  28.46 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  28.46 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  28.46 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  28.46 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  28.46 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  29.23 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  32.32 
 
 		 135 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 		 139 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  30.93 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  31.33 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  27.91 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  31.33 
 
 		 142 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  27.35 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  23.72 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  29.57 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  25.83 
 
 		 154 aa  40.8  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>