More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0088 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  100 
 
 		 78 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  91.03 
 
 		 78 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  88.46 
 
 		 78 aa  135  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  86.49 
 
 		 78 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  84.21 
 
 		 77 aa  123  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  81.58 
 
 		 79 aa  123  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  79.49 
 
 		 78 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  79.49 
 
 		 78 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  82.05 
 
 		 79 aa  121  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  82.05 
 
 		 79 aa  121  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  83.78 
 
 		 78 aa  120  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  83.78 
 
 		 78 aa  120  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  83.78 
 
 		 78 aa  120  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  76.92 
 
 		 78 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  76.92 
 
 		 78 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  76.92 
 
 		 78 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  77.03 
 
 		 78 aa  116  9e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  76.62 
 
 		 78 aa  116  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  75.64 
 
 		 79 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  76.62 
 
 		 78 aa  115  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  80.82 
 
 		 77 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  74.36 
 
 		 78 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  80.82 
 
 		 77 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  77.63 
 
 		 79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  77.63 
 
 		 79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  80.82 
 
 		 77 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  74.36 
 
 		 78 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  77.63 
 
 		 79 aa  114  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  77.63 
 
 		 79 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  77.33 
 
 		 77 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  77.63 
 
 		 79 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  77.63 
 
 		 78 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  79.45 
 
 		 77 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  77.63 
 
 		 79 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  77.63 
 
 		 79 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  74.32 
 
 		 79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  74.32 
 
 		 106 aa  110  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  76.71 
 
 		 77 aa  110  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  71.23 
 
 		 77 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  73.08 
 
 		 78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  70.51 
 
 		 79 aa  107  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  106  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  73.97 
 
 		 77 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  68.42 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  68.42 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  69.23 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  71.23 
 
 		 78 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  69.23 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  67.95 
 
 		 78 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  67.53 
 
 		 79 aa  104  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  69.23 
 
 		 79 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  69.74 
 
 		 79 aa  103  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  69.74 
 
 		 78 aa  103  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  71.05 
 
 		 76 aa  102  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  67.95 
 
 		 78 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  69.74 
 
 		 79 aa  102  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  71.23 
 
 		 78 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  69.74 
 
 		 79 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  69.74 
 
 		 79 aa  102  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  68.42 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  69.74 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 78 aa  100  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  67.53 
 
 		 78 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  70.42 
 
 		 75 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  67.53 
 
 		 78 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 78 aa  100  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 78 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  64.1 
 
 		 78 aa  100  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 78 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  64.94 
 
 		 78 aa  100  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  64.94 
 
 		 78 aa  100  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  65.38 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 79 aa  99.4  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  64.94 
 
 		 78 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  64.94 
 
 		 78 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  65.79 
 
 		 77 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 79 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 79 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  66.23 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 78 aa  99  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 79 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  68.42 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  67.12 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 79 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>