136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0080 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  100 
 
 		 428 aa  834    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  57.25 
 
 		 421 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  40.05 
 
 		 424 aa  299  5e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  34.47 
 
 		 420 aa  193  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  33.49 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  33.18 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  35.4 
 
 		 402 aa  176  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  31.36 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  37.93 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  33.93 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  30.1 
 
 		 443 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  29.84 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  32.07 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  31.83 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  32.86 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  32.9 
 
 		 412 aa  131  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  32 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  28.09 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  31.99 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  29.12 
 
 		 384 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  30.94 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  29.12 
 
 		 386 aa  126  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  30.91 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  31.03 
 
 		 389 aa  123  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  30.53 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  28.64 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  31.02 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  29.35 
 
 		 1498 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  28.61 
 
 		 386 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  31.9 
 
 		 420 aa  116  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  30.94 
 
 		 390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  27.74 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  29.41 
 
 		 384 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  31.76 
 
 		 429 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  27.41 
 
 		 388 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  30.63 
 
 		 419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  28.1 
 
 		 386 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  28.02 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  27.93 
 
 		 441 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  25.53 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  26.6 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  28.06 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  25.39 
 
 		 379 aa  107  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  27.78 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  27.56 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  26.34 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  29.14 
 
 		 471 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  26.42 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  26.06 
 
 		 467 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  27.06 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  28.15 
 
 		 475 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  26.15 
 
 		 1029 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  26.54 
 
 		 1010 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  26.65 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  25.9 
 
 		 1024 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  25.17 
 
 		 1029 aa  99.8  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  25.94 
 
 		 429 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  24.94 
 
 		 1024 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  28.35 
 
 		 422 aa  98.2  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  26.8 
 
 		 470 aa  97.8  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  26.18 
 
 		 429 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  25.43 
 
 		 763 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  24.94 
 
 		 1024 aa  97.1  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  25.46 
 
 		 839 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  26.35 
 
 		 428 aa  96.7  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  25.72 
 
 		 1029 aa  96.7  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  27.25 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  26 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  24.25 
 
 		 525 aa  94  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  27.85 
 
 		 435 aa  94  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  25.58 
 
 		 1018 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  25.52 
 
 		 448 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  24.41 
 
 		 1020 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  25.98 
 
 		 424 aa  91.3  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  26.44 
 
 		 1046 aa  91.3  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  25.97 
 
 		 392 aa  90.5  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  25.43 
 
 		 1010 aa  90.1  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  23.81 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  26.91 
 
 		 436 aa  89.7  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  25.11 
 
 		 469 aa  89.7  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  25.94 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  24.21 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  25.52 
 
 		 448 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  26.29 
 
 		 439 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  23.61 
 
 		 1024 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  25.98 
 
 		 376 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  24.82 
 
 		 908 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  24.74 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  24.74 
 
 		 376 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  24.47 
 
 		 1021 aa  87  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  24.93 
 
 		 376 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  24.47 
 
 		 373 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  24.74 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  24.74 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  25.2 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  24.74 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  25.2 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  24.87 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  24.83 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  23.6 
 
 		 1005 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>