More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0069 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1736  MCP methyltransferase, CheR-type  49.23 
 
 		 290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0460074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  46.59 
 
 		 285 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  46.59 
 
 		 285 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  46.34 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  38.43 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  40.16 
 
 		 280 aa  195  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  39.02 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  42.91 
 
 		 296 aa  191  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  40.3 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  36.59 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  38.41 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  38.72 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  41.11 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  41.37 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  39.38 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  42.53 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  39.68 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  39.77 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  42.37 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  36.76 
 
 		 292 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  39.67 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  37.22 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  37.79 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  35.06 
 
 		 414 aa  168  8e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  34.04 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  36.61 
 
 		 272 aa  162  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  38.84 
 
 		 275 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  36.68 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0095  MCP methyltransferase, CheR-type  38.49 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.33 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  33.86 
 
 		 278 aa  155  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  36.47 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  36.48 
 
 		 274 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  36.33 
 
 		 275 aa  152  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  36.08 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  33.99 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  32.49 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  33.98 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  35.37 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.98 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.72 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  36.99 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  42.56 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  33.98 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1604  MCP methyltransferase, CheR-type  33.2 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0143514  unclonable  1.76137e-23 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.81 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  35.77 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  34.55 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  35.37 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.96 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  34.92 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  35.37 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  35.37 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  32.94 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  34.55 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  34.55 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  34.55 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  34.55 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  34.96 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  34.55 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  34.55 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  31.15 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  29.02 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  34.55 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 		 316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.25 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  33.61 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  35.16 
 
 		 274 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  34.77 
 
 		 274 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  33.74 
 
 		 275 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  31.97 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.97 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  31.97 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  32.38 
 
 		 275 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  33.33 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  35.83 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2183  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  41.12 
 
 		 514 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  32.16 
 
 		 278 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.24 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.33 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2147  MCP methyltransferase, CheR-type  30.59 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  35.89 
 
 		 291 aa  126  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  34.71 
 
 		 277 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  38.38 
 
 		 288 aa  125  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  37.84 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2189  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  31.13 
 
 		 481 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  35.66 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2362  MCP methyltransferase, CheR-type  38.71 
 
 		 478 aa  122  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  30.86 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0713  MCP methyltransferase, CheR-type  31.63 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0048  MCP methyltransferase, CheR-type  36.57 
 
 		 269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  32.34 
 
 		 275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  34.05 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  29.55 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1683  protein-glutamate O-methyltransferase  36.57 
 
 		 269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.12913  hitchhiker  0.00192477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  34.34 
 
 		 485 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.96 
 
 		 1535 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>